More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00674 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00674  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 194 aa  400  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.65 
 
 		 240 aa  233  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0587  short chain dehydrogenase  53.09 
 
 		 237 aa  205  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2577  short chain dehydrogenase  50.76 
 
 		 240 aa  203  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2589  short chain dehydrogenase  51.28 
 
 		 240 aa  202  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0827  short chain dehydrogenase  49 
 
 		 250 aa  200  9e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3217  short chain dehydrogenase  51.55 
 
 		 239 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00454323  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1846  short chain dehydrogenase  52.58 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2270  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 240 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0772  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3337  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 239 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0616  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 239 aa  191  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0048  short chain dehydrogenase  50.79 
 
 		 235 aa  191  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3507  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.430968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3807  short chain dehydrogenase  47.29 
 
 		 248 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0169066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0611  short chain dehydrogenase  47.78 
 
 		 248 aa  188  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0577388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1592  short chain dehydrogenase  49.23 
 
 		 240 aa  187  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0574635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1815  short chain dehydrogenase  49.23 
 
 		 240 aa  187  9e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00999645  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01575  short chain dehydrogenase  49.23 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.23 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00181892  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1681  short chain dehydrogenase  49.23 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.290882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2317  short chain dehydrogenase  49.23 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.186144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3288  short chain dehydrogenase  49.74 
 
 		 236 aa  186  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2024  short chain dehydrogenase  49.23 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01565  hypothetical protein  49.23 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.740406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1793  short chain dehydrogenase  49.74 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0661152  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3683  short chain dehydrogenase  46.8 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1183  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  49.74 
 
 		 236 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1021  short chain dehydrogenase  49.22 
 
 		 236 aa  184  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3625  short chain dehydrogenase  46.8 
 
 		 248 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1691  short chain dehydrogenase  47.15 
 
 		 234 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0892  short chain dehydrogenase  48.7 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3161  short chain dehydrogenase  48.47 
 
 		 252 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10270  short chain dehydrogenase  46.46 
 
 		 262 aa  178  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19640  short chain dehydrogenase  46.11 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4632  short chain dehydrogenase  45.95 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4493  short chain dehydrogenase  46.28 
 
 		 245 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4617  short chain dehydrogenase  45.41 
 
 		 245 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0808  short chain dehydrogenase  44.86 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1865  short chain dehydrogenase  38.86 
 
 		 237 aa  128  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2118  Dihydrofolate reductase  34.83 
 
 		 251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.54 
 
 		 367 aa  91.3  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4223  short chain dehydrogenase/reductase family protein  26.6 
 
 		 237 aa  87.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0790726 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  33.54 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.19 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  28.34 
 
 		 264 aa  81.3  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  30.61 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  35.22 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  35.22 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.65 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.57 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.88 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  27.41 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  29.19 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0783  short chain dehydrogenase  27.75 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36858  normal  0.0521945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0696  pteridine reductase  30.82 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.454716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0046  short chain dehydrogenase  28.27 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  29.35 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  31.31 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  35.14 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0049  short chain dehydrogenase  28.27 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.129082  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0156  short chain dehydrogenase  27.32 
 
 		 267 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1713  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  35.85 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  29.02 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.27 
 
 		 249 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2311  short chain dehydrogenase  24.75 
 
 		 256 aa  68.2  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0239566 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 		 252 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.95 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.81 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.95 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  33.33 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  30.63 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2737  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.57 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02553  hypothetical protein  29.08 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.64 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2840  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.84 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  32.81 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.752171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2932  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.84 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1525  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  24.23 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2748  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.84 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3921  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.86 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.26 
 
 		 253 aa  64.7  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.17 
 
 		 257 aa  64.7  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0259  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  35.14 
 
 		 246 aa  64.7  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.91 
 
 		 262 aa  64.7  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.839848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>