More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1577 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
262 aa  535  1e-151  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.839848  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
264 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  35.41 
 
 
245 aa  146  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
245 aa  146  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  34.9 
 
 
245 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  36.86 
 
 
246 aa  142  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1713  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  31.73 
 
 
245 aa  142  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  34.9 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  34.38 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  38.46 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  34.51 
 
 
260 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  35.41 
 
 
251 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
241 aa  135  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  35.18 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.37 
 
 
246 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
237 aa  128  8.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.37 
 
 
246 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.02 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  36.65 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
253 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
247 aa  125  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  35.29 
 
 
259 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
235 aa  125  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0259  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  29.92 
 
 
246 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.93 
 
 
265 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.1 
 
 
249 aa  122  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.5 
 
 
247 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.1 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  33.73 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  30.04 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162076 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  32 
 
 
249 aa  118  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
290 aa  118  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
237 aa  118  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0987  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348394  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.23 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00209875  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0726  pteridine reductase  31.5 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
248 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.71 
 
 
257 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.129082  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1951  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.92 
 
 
247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1369  pteridine reductase  31.78 
 
 
267 aa  115  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000175176  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
236 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.4 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.28 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0995  pteridine reductase  31.42 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0277156  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.23 
 
 
247 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
262 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143414  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.29 
 
 
251 aa  112  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  32.22 
 
 
269 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.69 
 
 
246 aa  112  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3892  putative oxidoreductase  34.39 
 
 
244 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.300054  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
245 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
245 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0669  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0399726  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.76 
 
 
246 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.23 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.3 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3264  acetoin dehydrogenase  30.68 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0298905 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3920  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1344  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.07 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.118162  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0834  acetoin dehydrogenase  30.68 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.5 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02067  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  30.68 
 
 
253 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
253 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
265 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576946  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
255 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02025  hypothetical protein  30.68 
 
 
253 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01070  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.76 
 
 
238 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2427  acetoin dehydrogenase  30.68 
 
 
253 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1510  acetoin dehydrogenase  30.68 
 
 
253 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2272  acetoin dehydrogenase  30.68 
 
 
253 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.89 
 
 
248 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0797  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.02 
 
 
244 aa  108  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1295  dehydrogenase  31.17 
 
 
234 aa  109  6e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4414  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0396  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.94 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0906  acetoin dehydrogenase  30.12 
 
 
253 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.27 
 
 
259 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.46 
 
 
250 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 
246 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_642  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  30.08 
 
 
265 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100952  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0392  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.94 
 
 
258 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
250 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
247 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 
268 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1360  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.48 
 
 
243 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000468393  normal  0.0479743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>