More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0995 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0995  pteridine reductase  100 
 
 
267 aa  546  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0277156  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1369  pteridine reductase  87.64 
 
 
267 aa  481  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000175176  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  44.53 
 
 
249 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.12 
 
 
247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  45.93 
 
 
251 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  44.35 
 
 
245 aa  205  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  43.55 
 
 
246 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  44.76 
 
 
246 aa  202  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  45.12 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0726  pteridine reductase  42.06 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
246 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  44.18 
 
 
259 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  41.3 
 
 
245 aa  192  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  40.89 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  43.78 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 
245 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  41.53 
 
 
250 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0696  pteridine reductase  42.25 
 
 
255 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.454716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  41.3 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
242 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
264 aa  155  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
246 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  36.99 
 
 
246 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
237 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
248 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0985311  hitchhiker  0.000033531 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1713  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  32.13 
 
 
245 aa  138  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
248 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  37.5 
 
 
247 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
249 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
254 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
254 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
258 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
233 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
235 aa  123  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
257 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.129082  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0259  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  32.52 
 
 
246 aa  122  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  33.47 
 
 
255 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
277 aa  121  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16282  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0046  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 
272 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
247 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0049  short chain dehydrogenase  34.21 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 
367 aa  119  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
237 aa  119  6e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
233 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.87 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0182  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 
266 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229534  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2494  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.51 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000082608  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
273 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.75 
 
 
247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4344  short chain dehydrogenase  32.51 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0156  short chain dehydrogenase  34.13 
 
 
267 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  31.02 
 
 
251 aa  116  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
273 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
245 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
256 aa  115  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  31.02 
 
 
331 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  29.84 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41021  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  29.57 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.52 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.839848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  29.57 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  29.57 
 
 
261 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  29.57 
 
 
261 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 
265 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2521  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.48 
 
 
267 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233488  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.48 
 
 
267 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1548  pteridine reductase 1  35.48 
 
 
267 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0052  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.48 
 
 
267 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  31.25 
 
 
266 aa  112  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.34 
 
 
263 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1479  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.48 
 
 
267 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
255 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0050  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.48 
 
 
267 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.48 
 
 
267 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.350594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  29.57 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  31.43 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  29.84 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1429  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.66 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.865814 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.28 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212071  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  28.4 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>