More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3477 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
233 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  96.57 
 
 
233 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  97.42 
 
 
233 aa  360  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.22 
 
 
235 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143564 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  47.72 
 
 
245 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.83 
 
 
253 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  46.12 
 
 
260 aa  165  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  42.28 
 
 
245 aa  161  9e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  44.26 
 
 
251 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  42.28 
 
 
245 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
245 aa  159  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  38.66 
 
 
249 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
246 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  40.65 
 
 
246 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0696  pteridine reductase  45.8 
 
 
255 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.454716  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  41.74 
 
 
252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  37.04 
 
 
259 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  37.45 
 
 
259 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  38.46 
 
 
250 aa  148  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  38.27 
 
 
246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
252 aa  144  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1369  pteridine reductase  34.96 
 
 
267 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000175176  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 
246 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  41.08 
 
 
246 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0995  pteridine reductase  34.15 
 
 
267 aa  142  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0277156  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4344  short chain dehydrogenase  42.02 
 
 
250 aa  139  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0985311  hitchhiker  0.000033531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.91 
 
 
237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0156  short chain dehydrogenase  44.18 
 
 
267 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0726  pteridine reductase  35.83 
 
 
246 aa  132  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
247 aa  132  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
242 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
248 aa  129  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0049  short chain dehydrogenase  43.5 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0046  short chain dehydrogenase  43.67 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
235 aa  126  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 
245 aa  125  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
255 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1713  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  30.83 
 
 
245 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
252 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  41.7 
 
 
277 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
256 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0259  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  30.86 
 
 
246 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.129082  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  38.08 
 
 
268 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
270 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
290 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
248 aa  118  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0048  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01070  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.63 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
261 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0473977 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1075  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2858  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2736  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 
257 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.654094  normal  0.0783581 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.42 
 
 
263 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
249 aa  115  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2521  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1548  pteridine reductase 1  41 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1479  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233488  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.350594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0052  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41021  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  38.62 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  36.67 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2311  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
256 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0239566 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0050  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.46 
 
 
267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
258 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
241 aa  112  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.23 
 
 
247 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 
249 aa  112  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
248 aa  112  7.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.58 
 
 
246 aa  111  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.56 
 
 
248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0182  short chain dehydrogenase  40.65 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.33 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538738  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  33.74 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
273 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>