More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1846 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1846  short chain dehydrogenase  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0845615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01575  short chain dehydrogenase  79.92 
 
 
240 aa  401  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.92 
 
 
240 aa  401  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00181892  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1793  short chain dehydrogenase  80.33 
 
 
240 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0661152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1592  short chain dehydrogenase  79.92 
 
 
240 aa  401  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0574635  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01565  hypothetical protein  79.92 
 
 
240 aa  401  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.740406  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2317  short chain dehydrogenase  79.92 
 
 
240 aa  401  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.186144  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2024  short chain dehydrogenase  79.92 
 
 
240 aa  401  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1681  short chain dehydrogenase  79.92 
 
 
240 aa  401  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.290882  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1815  short chain dehydrogenase  80.33 
 
 
240 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00999645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2589  short chain dehydrogenase  68.97 
 
 
240 aa  333  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2577  short chain dehydrogenase  68.97 
 
 
240 aa  332  4e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2270  short chain dehydrogenase  68.97 
 
 
240 aa  330  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0048  short chain dehydrogenase  55.74 
 
 
235 aa  249  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3337  short chain dehydrogenase  55.51 
 
 
239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3507  short chain dehydrogenase  55.08 
 
 
239 aa  240  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.430968  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.14 
 
 
240 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0616  short chain dehydrogenase  54.66 
 
 
239 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689815  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0772  short chain dehydrogenase  54.66 
 
 
239 aa  235  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3217  short chain dehydrogenase  54.66 
 
 
239 aa  235  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00454323  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3625  short chain dehydrogenase  54.29 
 
 
248 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3683  short chain dehydrogenase  54.29 
 
 
248 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0827  short chain dehydrogenase  50.41 
 
 
250 aa  229  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371771  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3807  short chain dehydrogenase  53.06 
 
 
248 aa  228  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0169066  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0611  short chain dehydrogenase  53.06 
 
 
248 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0577388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1691  short chain dehydrogenase  50.43 
 
 
234 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0587  short chain dehydrogenase  48.72 
 
 
237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1183  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  49.57 
 
 
236 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1021  short chain dehydrogenase  49.13 
 
 
236 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3161  short chain dehydrogenase  50.42 
 
 
252 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0892  short chain dehydrogenase  49.36 
 
 
236 aa  215  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19640  short chain dehydrogenase  48.7 
 
 
234 aa  215  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3288  short chain dehydrogenase  48.74 
 
 
236 aa  214  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10270  short chain dehydrogenase  48.97 
 
 
262 aa  201  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00674  short chain dehydrogenase  52.58 
 
 
194 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1865  short chain dehydrogenase  40 
 
 
237 aa  180  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4493  short chain dehydrogenase  40.95 
 
 
245 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0808  short chain dehydrogenase  40.95 
 
 
230 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230501  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4617  short chain dehydrogenase  40.95 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4632  short chain dehydrogenase  40.95 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2118  Dihydrofolate reductase  38.24 
 
 
251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
238 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  32.65 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4223  short chain dehydrogenase/reductase family protein  27.78 
 
 
237 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0790726 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  30.42 
 
 
246 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
242 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 
246 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 
367 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  29.92 
 
 
245 aa  101  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  32.41 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  30.52 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.85 
 
 
264 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  30.74 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  29.92 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  32.41 
 
 
245 aa  95.9  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
264 aa  95.1  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  28.51 
 
 
249 aa  94  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
241 aa  92.8  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
246 aa  92.4  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.8 
 
 
246 aa  92.4  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  28.22 
 
 
252 aa  92  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  28.75 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0726  pteridine reductase  29.03 
 
 
246 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  29.58 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  28.45 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3521  oxidoreductase  26.51 
 
 
253 aa  85.1  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  28.45 
 
 
331 aa  85.1  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2487  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147298  normal  0.672807 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02553  hypothetical protein  35.71 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.22 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  28.93 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.05 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.25 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0985311  hitchhiker  0.000033531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  28.81 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
262 aa  79  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.839848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2758  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.55 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0263508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  30.74 
 
 
267 aa  78.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.83 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.83 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.73 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.31 
 
 
249 aa  77  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0696  pteridine reductase  28.03 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.454716  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  30 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3692  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31077  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
253 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.34 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0371739 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2801  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.24 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.79 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49109  normal  0.0150297 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>