More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3692 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3692  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31077  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0956  short chain dehydrogenase  79.44 
 
 		 256 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3571  short chain dehydrogenase  67.97 
 
 		 256 aa  358  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0445953  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4509  short chain dehydrogenase  69.17 
 
 		 257 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4641  short chain dehydrogenase  69.17 
 
 		 257 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299413  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.45 
 
 		 271 aa  314  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7060  short chain dehydrogenase  61.38 
 
 		 255 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0176  short chain dehydrogenase  61.79 
 
 		 255 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5592  short chain dehydrogenase  60.16 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0383111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3659  short chain dehydrogenase  60.16 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.821403  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4102  short chain dehydrogenase  59.11 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.188504 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4708  short chain dehydrogenase  60.16 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.978516  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4567  short chain dehydrogenase  58.94 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.000267636 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1106  short chain dehydrogenase  58.54 
 
 		 256 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179926  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1500  short chain dehydrogenase  57.81 
 
 		 256 aa  284  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0973  short chain dehydrogenase  57.42 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1335  short chain dehydrogenase  57.42 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2495  short chain dehydrogenase  57.42 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1235  short chain dehydrogenase  57.42 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0318  short chain dehydrogenase  57.42 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0594  short chain dehydrogenase  57.42 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.512344  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1308  short chain dehydrogenase  57.03 
 
 		 256 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480054  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3985  short chain dehydrogenase  55.86 
 
 		 256 aa  280  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.473882  normal  0.0186737 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4234  short chain dehydrogenase  57.32 
 
 		 252 aa  271  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3966  short chain dehydrogenase  56.4 
 
 		 251 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0133  short chain dehydrogenase  54.58 
 
 		 256 aa  241  7.999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 		 253 aa  188  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1600  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  46.69 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 		 265 aa  168  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3563  p-cumic alcohol dehydrogenase (CymB)  41.11 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0357  putative short-chain dehydrogenase  41.5 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0963856  hitchhiker  0.00000797271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.48 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432541  normal  0.506504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  39.52 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  41.27 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.523448  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  39.36 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.44 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  38.96 
 
 		 260 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.62 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 246 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.98 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5156  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  39.68 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1601  short chain dehydrogenase  40.41 
 
 		 253 aa  148  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000195486  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.63 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0751362 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.06 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4577  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4960  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4665  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 		 250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.147758  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 249 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.73 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2002  oxidoreductase  38.46 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0131  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.82 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0830  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  38.46 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  38.55 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.21 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.29 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4528  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.67 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  38.96 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.82 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1563  oxidoreductase  38.46 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.256146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1536  oxidoreductase  38.06 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  37.9 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245481  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  34.94 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.01 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>