More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0133 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0133  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 256 aa  511  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3966  short chain dehydrogenase  67.72 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3985  short chain dehydrogenase  54.98 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.473882  normal  0.0186737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0956  short chain dehydrogenase  56.57 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1500  short chain dehydrogenase  54.33 
 
 		 256 aa  254  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3659  short chain dehydrogenase  55.12 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.821403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4708  short chain dehydrogenase  55.12 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.978516  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5592  short chain dehydrogenase  55.12 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0383111 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0594  short chain dehydrogenase  54.72 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.512344  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1335  short chain dehydrogenase  54.72 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0973  short chain dehydrogenase  54.72 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0318  short chain dehydrogenase  54.72 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1235  short chain dehydrogenase  54.72 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2495  short chain dehydrogenase  54.72 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1308  short chain dehydrogenase  54.72 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480054  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1106  short chain dehydrogenase  53.94 
 
 		 256 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179926  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4567  short chain dehydrogenase  52.96 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.000267636 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7060  short chain dehydrogenase  53.54 
 
 		 255 aa  248  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4102  short chain dehydrogenase  52.57 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.188504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3692  short chain dehydrogenase  55.38 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31077  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3571  short chain dehydrogenase  53.78 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0445953  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4234  short chain dehydrogenase  53.36 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4509  short chain dehydrogenase  54.15 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4641  short chain dehydrogenase  54.15 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299413  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0176  short chain dehydrogenase  53.54 
 
 		 255 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54 
 
 		 271 aa  224  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0357  putative short-chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0963856  hitchhiker  0.00000797271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1600  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  41.2 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3563  p-cumic alcohol dehydrogenase (CymB)  39.3 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.64 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3963  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4528  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432541  normal  0.506504 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0825  hypothetical protein  36.33 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 		 266 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.66 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.4 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.25 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  36.11 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.534322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  36.11 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.523448  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1189  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169392  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  37.74 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.68 
 
 		 246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.07 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.138148 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.73 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.07 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  35.02 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.87 
 
 		 246 aa  125  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.87 
 
 		 246 aa  125  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.76 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.28 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.92 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  37.35 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  35.97 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.68 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.68 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.68 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.68 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.47 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.68 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  36.19 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.73 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>