More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0357 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0357  putative short-chain dehydrogenase  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0963856  hitchhiker  0.00000797271 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.01 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3563  p-cumic alcohol dehydrogenase (CymB)  40.56 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432541  normal  0.506504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 		 248 aa  164  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3692  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31077  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2129  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22780  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.8 
 
 		 251 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503497 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3963  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3571  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0445953  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4102  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.188504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1600  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  40.78 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 268 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1106  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179926  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4567  short chain dehydrogenase  40.4 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.000267636 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7060  short chain dehydrogenase  37.15 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2371  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase / Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4911  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4234  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961994  normal  0.547574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0956  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3966  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 251 aa  148  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.27 
 
 		 250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.147758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1576  gluconate 5-dehydrogenase  37.8 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1470  gluconate 5-dehydrogenase  37.8 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.890933  normal  0.0516654 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  37.8 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0222  gluconate 5-dehydrogenase  37.94 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3280  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3659  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.821403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5592  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0383111 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4708  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.978516  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4641  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299413  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4509  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04132  gluconate 5-dehydrogenase  36.86 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3985  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.473882  normal  0.0186737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04096  hypothetical protein  36.86 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4747  gluconate 5-dehydrogenase  36.86 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4522  gluconate 5-dehydrogenase  36.86 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0305607  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 248 aa  144  9e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.24 
 
 		 233 aa  144  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0176  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 		 282 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.75 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4887  gluconate 5-dehydrogenase  37.15 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.851377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1500  short chain dehydrogenase  36.86 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4831  gluconate 5-dehydrogenase  37.15 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4738  gluconate 5-dehydrogenase  37.15 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120281 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1189  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169392  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4768  gluconate 5-dehydrogenase  37.15 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136475  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1335  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2495  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0973  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0913  short chain dehydrogenase  42.19 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0594  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.512344  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1308  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480054  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1235  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4868  gluconate 5-dehydrogenase  37.15 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.113188 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0318  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  35.18 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2985  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0207781  normal  0.0184598 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0133  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.291511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 		 272 aa  138  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.15 
 
 		 247 aa  138  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.06 
 
 		 250 aa  138  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0416  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.47 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1608  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.55 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000263068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  35.29 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4577  short chain dehydrogenase  36.44 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0224708  unclonable  0.0000202886 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.3 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4960  short chain dehydrogenase  36.44 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4665  short chain dehydrogenase  36.44 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640028  hitchhiker  0.00000248708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>