More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4231 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
268 aa  543  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.41 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.529641  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0166508  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
256 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5444  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
256 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1957  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
259 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
273 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0078052  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3606  oxoacyl carrier protein reductase  41.02 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117732  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2917  putative reductase  41.02 
 
 
259 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
252 aa  146  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
252 aa  145  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
261 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.863836  normal  0.150227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
261 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
254 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3288  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 
260 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 
260 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  33.59 
 
 
257 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
257 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
255 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
260 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.730429  normal  0.182459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0949  gluconate 5-dehydrogenase  31.95 
 
 
264 aa  135  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
255 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
255 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09160  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
256 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02177  short chain dehydrogenase/oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15740)  33.72 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186122 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  34.24 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0987  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  31.52 
 
 
251 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3369  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  31.52 
 
 
251 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.589225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0935  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  31.52 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.203579  normal  0.799434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  31.37 
 
 
254 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
255 aa  132  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  31.5 
 
 
251 aa  132  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  31.37 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  31.1 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  33.33 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1470  gluconate 5-dehydrogenase  31.1 
 
 
254 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  31.76 
 
 
255 aa  129  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1576  gluconate 5-dehydrogenase  31.1 
 
 
289 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
257 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  32.81 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1716  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  31.1 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
270 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38255  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase, and sorbitol utilization protein  31.52 
 
 
282 aa  129  7.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  30.62 
 
 
261 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  30.98 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  30.62 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  30.62 
 
 
301 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
241 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.727774  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245481  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0222  gluconate 5-dehydrogenase  29.92 
 
 
254 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3818  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.91 
 
 
245 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0470155 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
254 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
254 aa  125  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.7 
 
 
261 aa  125  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2067  short chain dehydrogenase  30.08 
 
 
260 aa  125  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0224014 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.6 
 
 
247 aa  125  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  30.98 
 
 
260 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 
255 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  30.2 
 
 
258 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.87 
 
 
249 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2383  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  28.74 
 
 
253 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
254 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
260 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.2 
 
 
254 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
253 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
272 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1909  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  31.1 
 
 
253 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00371976  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1844  gluconate 5-dehydrogenase  33.2 
 
 
263 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250447  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  31.1 
 
 
262 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4263  gluconate 5-dehydrogenase  29.39 
 
 
263 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
256 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
252 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  29.69 
 
 
249 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2643  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.92 
 
 
253 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.802213  normal  0.105966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
263 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1803  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.92 
 
 
253 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1151  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.01 
 
 
234 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.256582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
255 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1693  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.92 
 
 
253 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.523034  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 
258 aa  122  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
254 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
261 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal  0.0404538 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2202  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  30.71 
 
 
253 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0344  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  28.74 
 
 
258 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.88 
 
 
245 aa  122  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11172  conserved hypothetical protein  33.6 
 
 
254 aa  122  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.118673  normal  0.802204 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1971  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  30.71 
 
 
253 aa  122  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2032  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  30.31 
 
 
253 aa  122  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 
256 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.936397  normal  0.224474 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
260 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3977  putative 2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.11 
 
 
255 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686311  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0669  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  28.91 
 
 
259 aa  122  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0399726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>