More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2067 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2067  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 260 aa  530  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0224014 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  79.23 
 
 		 260 aa  441  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  76.83 
 
 		 260 aa  427  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  76.92 
 
 		 260 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1896  short chain dehydrogenase  77.13 
 
 		 260 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3288  short chain dehydrogenase  74.23 
 
 		 260 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1448  short chain dehydrogenase  79.62 
 
 		 260 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  74.23 
 
 		 261 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  73.85 
 
 		 261 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  71.92 
 
 		 301 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  73.08 
 
 		 258 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1566  short chain dehydrogenase  72.31 
 
 		 258 aa  374  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1363  short chain dehydrogenase  72.31 
 
 		 258 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.737736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1147  short chain dehydrogenase  72.69 
 
 		 261 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  70.38 
 
 		 258 aa  367  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1263  short chain dehydrogenase  71.15 
 
 		 270 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4607  short chain dehydrogenase  70.77 
 
 		 260 aa  353  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1440  short chain dehydrogenase  70.77 
 
 		 260 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0980  short chain dehydrogenase  70.77 
 
 		 260 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1387  short chain dehydrogenase  70 
 
 		 258 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1462  short chain dehydrogenase  70.77 
 
 		 260 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1347  short chain dehydrogenase  69.62 
 
 		 258 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1716  short chain dehydrogenase  68.32 
 
 		 259 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1115  short chain dehydrogenase  68.32 
 
 		 259 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00652763  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0943  short chain dehydrogenase  68.32 
 
 		 259 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1870  short chain dehydrogenase  68.32 
 
 		 259 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0823567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2612  short chain dehydrogenase  68.7 
 
 		 259 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1692  short chain dehydrogenase  68.32 
 
 		 259 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.749857  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1557  short chain dehydrogenase  68.32 
 
 		 259 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396998  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0218  short chain dehydrogenase  68.32 
 
 		 259 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0481209  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.41 
 
 		 259 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.67 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.57 
 
 		 253 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 		 255 aa  228  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.12 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 263 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.51 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 		 263 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.83 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1212  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.19 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 258 aa  188  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.807197  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 249 aa  175  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.777235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.410014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35950  putative dehydrogenase  43.03 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00392824  hitchhiker  0.00000000000000176535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2794  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.63 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0563  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 252 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  36.92 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  36.09 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0981  2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase, putative  37.55 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  35.55 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0918  putative 2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase  37.55 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.311873  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.36 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  35.52 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  35.27 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  35.04 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  35.09 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  35.63 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  34.11 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  35.09 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  33.85 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  34.11 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 		 257 aa  154  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.343485  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  34.87 
 
 		 267 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  36.72 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  35.38 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3515  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.77 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  36.15 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>