More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1896 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1896  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 260 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  82.63 
 
 		 260 aa  454  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  80.62 
 
 		 260 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  80.23 
 
 		 260 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3288  short chain dehydrogenase  81.08 
 
 		 260 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2067  short chain dehydrogenase  77.13 
 
 		 260 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0224014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1448  short chain dehydrogenase  72.87 
 
 		 260 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  70.38 
 
 		 261 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  70 
 
 		 261 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  69.23 
 
 		 301 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  70.54 
 
 		 258 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1363  short chain dehydrogenase  69.77 
 
 		 258 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.737736 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1566  short chain dehydrogenase  69.77 
 
 		 258 aa  357  8e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  69.38 
 
 		 258 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1263  short chain dehydrogenase  68.46 
 
 		 270 aa  354  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1147  short chain dehydrogenase  68.46 
 
 		 261 aa  350  8.999999999999999e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1387  short chain dehydrogenase  68.6 
 
 		 258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4607  short chain dehydrogenase  69.38 
 
 		 260 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1347  short chain dehydrogenase  68.22 
 
 		 258 aa  337  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1440  short chain dehydrogenase  69.38 
 
 		 260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0980  short chain dehydrogenase  69.38 
 
 		 260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1462  short chain dehydrogenase  69.38 
 
 		 260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1115  short chain dehydrogenase  66.54 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00652763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1870  short chain dehydrogenase  66.54 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0823567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0943  short chain dehydrogenase  66.54 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1692  short chain dehydrogenase  66.54 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.749857  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1557  short chain dehydrogenase  66.54 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396998  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0218  short chain dehydrogenase  66.54 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0481209  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1716  short chain dehydrogenase  66.54 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2612  short chain dehydrogenase  66.02 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.83 
 
 		 259 aa  250  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 		 253 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 		 253 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.63 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.9 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1212  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.9 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 263 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 		 250 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 		 253 aa  204  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  39.37 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.807197  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 		 253 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 260 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  36.36 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 254 aa  168  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35950  putative dehydrogenase  40.08 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00392824  hitchhiker  0.00000000000000176535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  35.02 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  35.91 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2794  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.47 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.777235  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  39.08 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  36.72 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  33.72 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  37.5 
 
 		 259 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  38.98 
 
 		 251 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.410014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000923  5-keto-D-gluconate 5-reductase  39.45 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  39.22 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.91 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  37.45 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  37.21 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  34.98 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  36.22 
 
 		 255 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  34.98 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  34.98 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 		 257 aa  156  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  35.91 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  36.29 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>