More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2718 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 253 aa  484  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.410014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.98 
 
 		 253 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.23 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.8 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.37 
 
 		 263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.78 
 
 		 263 aa  240  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.23 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.807197  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 		 250 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.777235  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 		 251 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.01 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35950  putative dehydrogenase  54.66 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00392824  hitchhiker  0.00000000000000176535 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.25 
 
 		 258 aa  214  9e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2794  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  54.25 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.69 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.23 
 
 		 281 aa  205  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  44.23 
 
 		 261 aa  197  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2067  short chain dehydrogenase  43.65 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0224014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  43.85 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  44.23 
 
 		 301 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1212  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.36 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  43.25 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  42.53 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  45.24 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1896  short chain dehydrogenase  42.25 
 
 		 260 aa  184  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3288  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1448  short chain dehydrogenase  43.8 
 
 		 260 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1263  short chain dehydrogenase  44.62 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1147  short chain dehydrogenase  45 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1566  short chain dehydrogenase  43.19 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  42.75 
 
 		 258 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  44.14 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1440  short chain dehydrogenase  44.36 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1387  short chain dehydrogenase  43.92 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0980  short chain dehydrogenase  44.36 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1462  short chain dehydrogenase  44.36 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1363  short chain dehydrogenase  42.02 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.737736 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1347  short chain dehydrogenase  43.92 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4607  short chain dehydrogenase  43.97 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0981  2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase, putative  42.4 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0918  putative 2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase  42.4 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.311873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  42 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 259 aa  161  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2612  short chain dehydrogenase  42.58 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1115  short chain dehydrogenase  42.97 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00652763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1870  short chain dehydrogenase  42.97 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0823567  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1692  short chain dehydrogenase  42.97 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.749857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1716  short chain dehydrogenase  42.97 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0943  short chain dehydrogenase  42.97 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0218  short chain dehydrogenase  42.97 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0481209  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1557  short chain dehydrogenase  42.97 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396998  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 		 253 aa  150  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  38.15 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  42.11 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  40 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.246968  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245481  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  38.21 
 
 		 254 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  38.21 
 
 		 254 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01006  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  37.5 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.228313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>