More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1440 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4607  short chain dehydrogenase  99.62 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1440  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 260 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0980  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 260 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1462  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 260 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  97.69 
 
 		 258 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1387  short chain dehydrogenase  97.69 
 
 		 258 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1347  short chain dehydrogenase  97.31 
 
 		 258 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0943  short chain dehydrogenase  94.23 
 
 		 259 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1692  short chain dehydrogenase  94.23 
 
 		 259 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.749857  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1115  short chain dehydrogenase  94.23 
 
 		 259 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00652763  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1557  short chain dehydrogenase  94.23 
 
 		 259 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1870  short chain dehydrogenase  94.23 
 
 		 259 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0823567  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1566  short chain dehydrogenase  88.46 
 
 		 258 aa  447  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1716  short chain dehydrogenase  94.23 
 
 		 259 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0218  short chain dehydrogenase  94.23 
 
 		 259 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0481209  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2612  short chain dehydrogenase  94.23 
 
 		 259 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  87.31 
 
 		 258 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1363  short chain dehydrogenase  86.92 
 
 		 258 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.737736 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  80 
 
 		 301 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  77.69 
 
 		 261 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  77.31 
 
 		 261 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1263  short chain dehydrogenase  76.92 
 
 		 270 aa  380  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  71.43 
 
 		 260 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2067  short chain dehydrogenase  70.77 
 
 		 260 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0224014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1147  short chain dehydrogenase  77.69 
 
 		 261 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  71.15 
 
 		 260 aa  381  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  69.23 
 
 		 260 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1896  short chain dehydrogenase  69.38 
 
 		 260 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3288  short chain dehydrogenase  68.85 
 
 		 260 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1448  short chain dehydrogenase  69.62 
 
 		 260 aa  358  5e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.47 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.47 
 
 		 263 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.09 
 
 		 263 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.18 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1212  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.26 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.98 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 		 258 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.79 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 		 257 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.807197  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.777235  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0981  2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase, putative  43.58 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0918  putative 2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase  43.58 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.311873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2794  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.92 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 258 aa  181  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  42.97 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 		 281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35950  putative dehydrogenase  43.75 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00392824  hitchhiker  0.00000000000000176535 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 254 aa  175  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.31 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  38.58 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  39.37 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  37.17 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  37.45 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  39.45 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.410014 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.43 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3360  gluconate 5-dehydrogenase  41.63 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319469  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  38.43 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  39.06 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  38.74 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1695  gluconate 5-dehydrogenase  40.23 
 
 		 263 aa  162  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2008  gluconate 5-dehydrogenase  40.23 
 
 		 263 aa  162  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  38.04 
 
 		 259 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  38.04 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  38.04 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  37.5 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  35.94 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  36.76 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  36.36 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  39.37 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>