More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1557 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1115  short chain dehydrogenase  100 
 
 
259 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00652763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1870  short chain dehydrogenase  100 
 
 
259 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0823567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1557  short chain dehydrogenase  100 
 
 
259 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0943  short chain dehydrogenase  100 
 
 
259 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1716  short chain dehydrogenase  100 
 
 
259 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0218  short chain dehydrogenase  100 
 
 
259 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0481209  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1692  short chain dehydrogenase  100 
 
 
259 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.749857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2612  short chain dehydrogenase  98.07 
 
 
259 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  93.05 
 
 
258 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4607  short chain dehydrogenase  94.62 
 
 
260 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183292  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1440  short chain dehydrogenase  94.23 
 
 
260 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0980  short chain dehydrogenase  94.23 
 
 
260 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1462  short chain dehydrogenase  94.23 
 
 
260 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1387  short chain dehydrogenase  93.44 
 
 
258 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1347  short chain dehydrogenase  93.05 
 
 
258 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1566  short chain dehydrogenase  86.1 
 
 
258 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  86.49 
 
 
258 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1363  short chain dehydrogenase  85.71 
 
 
258 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.737736 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  79.23 
 
 
301 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  76.92 
 
 
261 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  76.54 
 
 
261 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1147  short chain dehydrogenase  76.92 
 
 
261 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1263  short chain dehydrogenase  75.38 
 
 
270 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  68.58 
 
 
260 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2067  short chain dehydrogenase  68.32 
 
 
260 aa  371  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0224014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  68.32 
 
 
260 aa  367  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  67.94 
 
 
260 aa  367  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1896  short chain dehydrogenase  66.54 
 
 
260 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1448  short chain dehydrogenase  68.32 
 
 
260 aa  353  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213081  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3288  short chain dehydrogenase  66.67 
 
 
260 aa  350  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.59 
 
 
259 aa  259  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.45 
 
 
263 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.48 
 
 
253 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.45 
 
 
263 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
253 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
253 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1212  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.99 
 
 
253 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
251 aa  214  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.36 
 
 
253 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
253 aa  210  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
258 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
250 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 
257 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.807197  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 
258 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
253 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
256 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.777235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
260 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
249 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  42.35 
 
 
263 aa  182  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2794  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.71 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0981  2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase, putative  41.04 
 
 
249 aa  181  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0918  putative 2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase  41.04 
 
 
249 aa  181  9.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.311873  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
258 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 
258 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35950  putative dehydrogenase  43.92 
 
 
255 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00392824  hitchhiker  0.00000000000000176535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
255 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  39.22 
 
 
267 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
259 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
254 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  39.61 
 
 
264 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
249 aa  168  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  38.76 
 
 
255 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3360  gluconate 5-dehydrogenase  40.78 
 
 
263 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319469  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
257 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  37.6 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
272 aa  165  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  36.19 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  36.86 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
256 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2008  gluconate 5-dehydrogenase  39.61 
 
 
263 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
257 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1695  gluconate 5-dehydrogenase  39.61 
 
 
263 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.72 
 
 
251 aa  163  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.343485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.410014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  38.28 
 
 
262 aa  161  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 
254 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
257 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  38.89 
 
 
254 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  35.41 
 
 
257 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
254 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
257 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1844  gluconate 5-dehydrogenase  37.89 
 
 
263 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250447  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
252 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  37.11 
 
 
260 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
257 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
255 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
258 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  37.8 
 
 
259 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 
254 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
254 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
256 aa  159  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  36.9 
 
 
255 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
253 aa  158  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>