More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2917 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2917  putative reductase  100 
 
 
259 aa  526  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1957  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.1 
 
 
259 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3606  oxoacyl carrier protein reductase  85.71 
 
 
259 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117732  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.78 
 
 
273 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0078052  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.02 
 
 
260 aa  305  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.730429  normal  0.182459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.52 
 
 
260 aa  264  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.529641  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.08 
 
 
260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0166508  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5444  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.1 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102615  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.45 
 
 
256 aa  238  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.66 
 
 
261 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.863836  normal  0.150227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
268 aa  188  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
257 aa  170  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3515  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.76 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
254 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
257 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
255 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
252 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
270 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
252 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.04 
 
 
250 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
272 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  33.33 
 
 
258 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
260 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
257 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.55 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
259 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01160  LSDR, putative  33.7 
 
 
293 aa  146  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3035  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.28 
 
 
251 aa  145  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0563  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
252 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0344  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.11 
 
 
258 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
256 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  34.38 
 
 
257 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.68 
 
 
251 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0222  gluconate 5-dehydrogenase  34.25 
 
 
254 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5273  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.55 
 
 
260 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3818  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.78 
 
 
245 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0470155 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
248 aa  142  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
256 aa  142  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
256 aa  142  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
260 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
251 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
251 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
276 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.57 
 
 
247 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.18 
 
 
246 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  35.98 
 
 
259 aa  141  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  32.03 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  33.86 
 
 
254 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.52 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1576  gluconate 5-dehydrogenase  33.99 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0987  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348394  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1470  gluconate 5-dehydrogenase  33.86 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1896  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.28 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.176277 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0396  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.33 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0392  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.33 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.73 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.13 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
254 aa  138  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
263 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
256 aa  138  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358595  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.97 
 
 
248 aa  137  1e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1428  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.72 
 
 
254 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.493611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0498  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.66 
 
 
252 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.726139  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  35.02 
 
 
261 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.52 
 
 
246 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
248 aa  138  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0748  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.98 
 
 
251 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177526  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0118  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.24 
 
 
256 aa  137  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
257 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  32.81 
 
 
256 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
257 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1253  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.29 
 
 
255 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
256 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0778  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.55 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0987  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.95 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3369  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.95 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.589225 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  32.94 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  37.8 
 
 
254 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  34.75 
 
 
252 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 
258 aa  135  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
255 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0935  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.95 
 
 
251 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.38 
 
 
251 aa  135  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
248 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672798  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
261 aa  135  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.718128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1151  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.89 
 
 
234 aa  135  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.256582 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04132  gluconate 5-dehydrogenase  32.41 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
265 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  32.94 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>