More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3787 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  499  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
252 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
253 aa  195  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
255 aa  175  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
252 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432541  normal  0.506504 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0357  putative short-chain dehydrogenase  37.92 
 
 
246 aa  164  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0963856  hitchhiker  0.00000797271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
244 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.291511  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2129  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
255 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3563  p-cumic alcohol dehydrogenase (CymB)  38.62 
 
 
252 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3571  short chain dehydrogenase  43.08 
 
 
256 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0445953  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1189  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
258 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169392  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3692  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 
256 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31077  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
252 aa  148  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1600  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  40.64 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7060  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4509  short chain dehydrogenase  41.43 
 
 
257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4641  short chain dehydrogenase  41.43 
 
 
257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299413  normal  0.128301 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
248 aa  145  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4234  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 
252 aa  144  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
271 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0396  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.08 
 
 
258 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0956  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 
256 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
249 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
250 aa  142  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.147758  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0392  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.68 
 
 
258 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0176  short chain dehydrogenase  37.11 
 
 
255 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
249 aa  141  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4102  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 
256 aa  141  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.188504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
268 aa  141  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1335  short chain dehydrogenase  40 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0318  short chain dehydrogenase  40 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2495  short chain dehydrogenase  40 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0973  short chain dehydrogenase  40 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1671  Short-chain alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.321944  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0594  short chain dehydrogenase  40 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.512344  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0118  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.1 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1235  short chain dehydrogenase  40 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1308  short chain dehydrogenase  40 
 
 
256 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480054  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
253 aa  138  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3985  short chain dehydrogenase  38 
 
 
256 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.473882  normal  0.0186737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
234 aa  138  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
249 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1500  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 
256 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3966  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 
251 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4567  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 
256 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.000267636 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
251 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4911  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
246 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0133  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 
256 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
253 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3280  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 
257 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5592  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 
256 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0383111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3659  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 
256 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.821403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
233 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
233 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4708  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 
256 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.978516  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1106  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
256 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179926  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.66 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  36.33 
 
 
259 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.10295  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.67 
 
 
247 aa  132  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
237 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0922  Short-chain alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
256 aa  132  6.999999999999999e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000799282  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
260 aa  131  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.26 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22780  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  36.22 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503497 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.68 
 
 
246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.37 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  36.68 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
253 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
248 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
251 aa  129  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00521448  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
252 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.890933  normal  0.0516654 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0474  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 
254 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.68 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0344  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.34 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  34.75 
 
 
256 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
295 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
295 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
250 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.87 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  35.25 
 
 
258 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  34.5 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>