More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3707 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
267 aa  539  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.36 
 
 
253 aa  268  8.999999999999999e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000418477  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 
265 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.38 
 
 
255 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.218864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.67 
 
 
256 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.186116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337839  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
256 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3659  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 
256 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.821403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4708  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 
256 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.978516  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5592  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 
256 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0383111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1563  short-chain alcohol dehydrogenase  37.15 
 
 
266 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147181  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1106  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 
256 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179926  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4102  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 
256 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.188504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0956  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 
256 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3985  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 
256 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.473882  normal  0.0186737 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2335  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.78 
 
 
253 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3571  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 
256 aa  151  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0445953  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
245 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4567  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 
256 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.000267636 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
256 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
233 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3692  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31077  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7060  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
273 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.95 
 
 
246 aa  145  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0594  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.512344  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1335  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2495  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1601  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
253 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786043  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
269 aa  145  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115705  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0973  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1235  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0318  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1500  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 
256 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5156  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
254 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215894  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
233 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
275 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
246 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1308  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
256 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
256 aa  141  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal  0.695361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4960  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4577  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4665  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.4 
 
 
249 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.25 
 
 
247 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3615  putative dehydrogenase  36.51 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.427411  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
244 aa  139  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
257 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
249 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
250 aa  138  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0176  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  38.74 
 
 
252 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.47 
 
 
249 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
234 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 
258 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  34 
 
 
259 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
254 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.11 
 
 
249 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
246 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
246 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.679351  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
247 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
257 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10784  short chain dehydrogenase  37.75 
 
 
248 aa  135  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
264 aa  135  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4641  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299413  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4509  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.14 
 
 
246 aa  135  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
258 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
252 aa  135  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.14 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.22 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.14 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.89 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.86 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.14 
 
 
246 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
253 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
249 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  30.4 
 
 
247 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  30.4 
 
 
247 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
265 aa  132  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0669  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.71 
 
 
247 aa  132  6e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.154574  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
262 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.449254  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
247 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
247 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
251 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000195486  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
249 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.73 
 
 
246 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>