143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_27 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_27  Na+/H+ antiporter C-terminal domain/universal stress protein-like protein  100 
 
 		 142 aa  285  2e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.547805  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0028  universal stress protein  98.59 
 
 		 142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.406249  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0027  UspA domain-containing protein  97.89 
 
 		 142 aa  279  9e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1706  UspA domain protein  40.44 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.72 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.48 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  31.65 
 
 		 745 aa  60.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  31.34 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1346  hypothetical protein  27.94 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000172915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2910  UspA domain protein  26.58 
 
 		 649 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12405  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.69 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.94 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.93 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.47 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  26.71 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  27.54 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.68 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  32.87 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  24.49 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  28.06 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  27.82 
 
 		 859 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  30.08 
 
 		 862 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  27.08 
 
 		 311 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.37 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  25.85 
 
 		 173 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  28.57 
 
 		 863 aa  51.2  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1642  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  27.07 
 
 		 699 aa  50.8  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.86 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  30.34 
 
 		 317 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  27.66 
 
 		 157 aa  50.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  27.27 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  28.17 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  24.66 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30.99 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  26.35 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  28.47 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 297 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  26.95 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  26.71 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  26.76 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  27.27 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1401  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  27.07 
 
 		 699 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.972731  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  23.61 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  23.97 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  28.38 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 297 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  25.53 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 		 706 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  30.34 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  27.41 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  26.76 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  26.28 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  27.27 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  25.69 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.21 
 
 		 290 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  22.97 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 		 732 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  26.81 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  26.81 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  25.56 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.5 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  27.01 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  25.69 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  25.18 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  25.9 
 
 		 716 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  33.65 
 
 		 786 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  28.35 
 
 		 748 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 764 aa  42.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  27.61 
 
 		 390 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  27.74 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  27.59 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  27.14 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  24.83 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>