More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3830 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
706 aa  1411    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  71.57 
 
 
708 aa  980    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  46.3 
 
 
751 aa  631  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  46.85 
 
 
716 aa  624  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  48.14 
 
 
732 aa  616  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  44.69 
 
 
721 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  43.48 
 
 
727 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  42.02 
 
 
716 aa  550  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 
719 aa  512  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  38.48 
 
 
715 aa  470  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  35.27 
 
 
688 aa  394  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  32.99 
 
 
709 aa  384  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  36.11 
 
 
689 aa  333  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  35.87 
 
 
679 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  38.35 
 
 
681 aa  318  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  30.56 
 
 
686 aa  317  3e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0038  sodium/hydrogen exchanger  30.47 
 
 
692 aa  293  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  26.69 
 
 
712 aa  263  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 
698 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 
698 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 
692 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  25.13 
 
 
722 aa  224  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1642  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  27.64 
 
 
699 aa  189  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1401  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  27.82 
 
 
699 aa  182  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.972731  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0307  Na+/H+ antiporter  33.5 
 
 
408 aa  170  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  27.95 
 
 
395 aa  102  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.06 
 
 
386 aa  102  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  29.35 
 
 
609 aa  98.6  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.33 
 
 
609 aa  97.8  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  29.33 
 
 
609 aa  97.8  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  29.33 
 
 
609 aa  97.8  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.75 
 
 
609 aa  97.8  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.33 
 
 
609 aa  97.8  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  29.33 
 
 
609 aa  97.8  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  29.33 
 
 
609 aa  97.4  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 
609 aa  97.4  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  29 
 
 
609 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 
396 aa  94.4  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.33 
 
 
609 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 
611 aa  92.8  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  24.84 
 
 
614 aa  87.4  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  33.55 
 
 
387 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
614 aa  85.5  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
614 aa  85.5  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.78 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  24.16 
 
 
756 aa  84  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 
389 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  30.57 
 
 
389 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  27.76 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  27.76 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  27.09 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  27.76 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  28.87 
 
 
767 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  25.5 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  27.42 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  27.42 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  27.42 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  27.42 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  26 
 
 
387 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  26 
 
 
387 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  26.83 
 
 
567 aa  79.7  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  26.17 
 
 
482 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.75 
 
 
608 aa  78.2  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  25.23 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  23.2 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  27.3 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  27.08 
 
 
375 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.55 
 
 
567 aa  76.6  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  24.56 
 
 
423 aa  76.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  26.48 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  26.13 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  27.08 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  27.08 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.08 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  27.08 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  27.08 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  23.82 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  25.95 
 
 
567 aa  74.3  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.21 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  21.91 
 
 
530 aa  73.9  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  27.83 
 
 
562 aa  73.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  25.15 
 
 
767 aa  73.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  24.73 
 
 
609 aa  73.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  24.15 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  24.51 
 
 
747 aa  71.2  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  24.2 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  24.06 
 
 
566 aa  70.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  26.55 
 
 
416 aa  70.5  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  25.37 
 
 
390 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  25.43 
 
 
412 aa  69.7  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  24.11 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  21.25 
 
 
715 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  21.06 
 
 
715 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  23.58 
 
 
748 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  25.88 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  26.37 
 
 
467 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  23.67 
 
 
764 aa  67.4  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  26.37 
 
 
467 aa  67.4  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  23.87 
 
 
661 aa  67.4  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>