More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2910 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2910  UspA domain protein  100 
 
 
649 aa  1259    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12405  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  35.95 
 
 
636 aa  340  7e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  32.09 
 
 
455 aa  194  6e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 
521 aa  144  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.51 
 
 
489 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 
485 aa  115  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 
500 aa  110  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0608  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 
444 aa  108  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26378  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 
491 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 
431 aa  106  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 
480 aa  104  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 
473 aa  104  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  25.95 
 
 
480 aa  103  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 
439 aa  102  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  23.48 
 
 
496 aa  102  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 
466 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 
466 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 
492 aa  101  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 
476 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 
454 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  27.18 
 
 
543 aa  100  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  23.36 
 
 
483 aa  99.8  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  26.65 
 
 
422 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  25.24 
 
 
468 aa  99.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  25.41 
 
 
486 aa  97.8  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 
796 aa  98.2  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  25.41 
 
 
486 aa  97.8  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  24.2 
 
 
486 aa  97.8  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  26.72 
 
 
454 aa  97.8  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  23.57 
 
 
495 aa  97.4  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  25 
 
 
468 aa  97.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  25 
 
 
468 aa  97.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  25 
 
 
468 aa  97.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  28.21 
 
 
446 aa  96.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 
466 aa  96.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  25.47 
 
 
500 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 
466 aa  95.9  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 
504 aa  96.3  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  23.78 
 
 
745 aa  95.1  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 
436 aa  95.5  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  27.27 
 
 
543 aa  95.1  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 
517 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1335  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 
430 aa  95.1  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.654483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 
486 aa  94.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 
494 aa  94.4  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  23.65 
 
 
476 aa  93.2  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  24.06 
 
 
467 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 
481 aa  93.6  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  23.13 
 
 
502 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 
480 aa  92.8  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  29.08 
 
 
476 aa  92.8  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 
468 aa  92.8  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 
495 aa  92.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  23.63 
 
 
467 aa  92  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  24.06 
 
 
467 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 
506 aa  92  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  23.63 
 
 
467 aa  92  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  23.63 
 
 
467 aa  92  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 
489 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  24.06 
 
 
467 aa  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  23.82 
 
 
467 aa  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  24.06 
 
 
467 aa  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  23.82 
 
 
467 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  25.25 
 
 
483 aa  91.3  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 
469 aa  90.9  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1531  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 
479 aa  90.9  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  23.63 
 
 
467 aa  90.9  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  23.63 
 
 
467 aa  90.9  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  23.82 
 
 
467 aa  90.9  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  23.63 
 
 
467 aa  90.9  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  23.63 
 
 
467 aa  90.9  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  23.82 
 
 
467 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 
468 aa  90.5  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  25 
 
 
480 aa  90.5  9e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  25.11 
 
 
449 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 
486 aa  89.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  24 
 
 
466 aa  89.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  22.14 
 
 
476 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 
510 aa  89.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  23.06 
 
 
471 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  22.94 
 
 
496 aa  89  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  23.06 
 
 
471 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0055  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 
428 aa  89.4  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.195903  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 
475 aa  88.6  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 
449 aa  89  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 
496 aa  89  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 
496 aa  89  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4360  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 
686 aa  88.2  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120164  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  23.38 
 
 
463 aa  88.2  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 
517 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 
481 aa  87.8  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  24 
 
 
464 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 
465 aa  87.4  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 
466 aa  87.4  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  22.57 
 
 
471 aa  87  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  21.78 
 
 
471 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  21.78 
 
 
471 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 
486 aa  87  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  21.9 
 
 
489 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  21.64 
 
 
478 aa  86.7  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>