More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0305 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  100 
 
 
468 aa  917    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  53.74 
 
 
486 aa  488  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  53.51 
 
 
468 aa  460  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  51.82 
 
 
480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  52.03 
 
 
480 aa  451  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1531  amino acid permease-associated region  49.24 
 
 
479 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20300  amino acid transporter  49.19 
 
 
471 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.533363  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0244  amino acid permease-associated region  50.23 
 
 
475 aa  398  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.912876  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0974  amino acid permease-associated region  32.68 
 
 
502 aa  217  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0221  amino acid permease-associated region  29.46 
 
 
490 aa  206  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0621  amino acid permease-associated region  30.86 
 
 
494 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0607  amino acid permease-associated region  30.86 
 
 
494 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0232  amino acid permease family protein  31.52 
 
 
496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21570  amino acid transporter  28.24 
 
 
503 aa  177  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.393168  hitchhiker  0.00168939 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1276  amino acid permease-associated region  30.04 
 
 
480 aa  175  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3189  amino acid permease-associated region  30.34 
 
 
482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0730  amino acid permease family protein  26.23 
 
 
436 aa  156  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0717  amino acid permease family protein  26.58 
 
 
443 aa  156  9e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22930  amino acid transporter  25.78 
 
 
494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0974202 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 
770 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1866  amino acid permease-associated region  29.35 
 
 
458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  28.82 
 
 
485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 
566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  26.32 
 
 
476 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25.66 
 
 
483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 
455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0152  amino acid permease family protein  27.84 
 
 
451 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.237797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  27.46 
 
 
528 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  30.52 
 
 
786 aa  128  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 
517 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 
488 aa  126  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  27.01 
 
 
481 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 
500 aa  126  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 
496 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 
476 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 
486 aa  124  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 
476 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  26.62 
 
 
471 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  26.62 
 
 
471 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  26.62 
 
 
471 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  27.94 
 
 
466 aa  122  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 
476 aa  123  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  30 
 
 
745 aa  123  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.83 
 
 
471 aa  122  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.53 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  23.98 
 
 
489 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.95 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.48 
 
 
471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 
468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.27 
 
 
471 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  25.29 
 
 
503 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 
491 aa  121  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  24.95 
 
 
467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.07 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.07 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.07 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.07 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.07 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25.31 
 
 
467 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  26.76 
 
 
528 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 
439 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.57 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.57 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  26.7 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  26.75 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  26.65 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  26.25 
 
 
525 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 
506 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  25.3 
 
 
486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  26.93 
 
 
471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 
467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  25.3 
 
 
486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 
490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  27.68 
 
 
445 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.81 
 
 
467 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  24.69 
 
 
467 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  27.63 
 
 
463 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.34 
 
 
467 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  26.04 
 
 
471 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  26.17 
 
 
467 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25.1 
 
 
467 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 
465 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 
555 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  25.33 
 
 
483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 
549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 
518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  26.72 
 
 
471 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  26.72 
 
 
471 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  24.13 
 
 
486 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  26.93 
 
 
471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  27.25 
 
 
463 aa  114  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 
494 aa  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  26.71 
 
 
467 aa  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 
492 aa  113  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  27.66 
 
 
422 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 
466 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>