More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1769 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  100 
 
 
439 aa  860    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  46.8 
 
 
436 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  41.08 
 
 
422 aa  330  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  37.85 
 
 
418 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  33.68 
 
 
455 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  33.8 
 
 
452 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  35.49 
 
 
446 aa  210  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  38.59 
 
 
412 aa  210  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  34.9 
 
 
394 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  33.25 
 
 
446 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  33.48 
 
 
483 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  29.48 
 
 
494 aa  207  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  38.17 
 
 
394 aa  206  9e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  34.15 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  33.25 
 
 
454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  34.13 
 
 
451 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  34.36 
 
 
433 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  33.09 
 
 
472 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  37.2 
 
 
445 aa  195  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  31.25 
 
 
500 aa  195  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  31.99 
 
 
489 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  31.19 
 
 
475 aa  192  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  35.99 
 
 
439 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  31.83 
 
 
486 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 
476 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  30.72 
 
 
437 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  33.17 
 
 
438 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  32.41 
 
 
451 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  32.41 
 
 
451 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  33.02 
 
 
451 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  31.24 
 
 
495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  33.56 
 
 
454 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 
476 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  29.5 
 
 
471 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  29.8 
 
 
486 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  31.04 
 
 
496 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  29.96 
 
 
490 aa  182  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  29.8 
 
 
486 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  34.98 
 
 
411 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  29.5 
 
 
471 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  29.5 
 
 
471 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  29.5 
 
 
471 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  29.28 
 
 
471 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  29.5 
 
 
471 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  29.5 
 
 
471 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  32 
 
 
483 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  30.96 
 
 
474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  29.44 
 
 
483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  30.69 
 
 
470 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  30.69 
 
 
470 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  30.69 
 
 
470 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  29.28 
 
 
471 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  29.07 
 
 
471 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  29.44 
 
 
471 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  30.87 
 
 
471 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  32.86 
 
 
479 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  30.87 
 
 
471 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  32.52 
 
 
538 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  32.91 
 
 
461 aa  177  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  29.27 
 
 
467 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.88 
 
 
467 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.88 
 
 
467 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 
506 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  30.87 
 
 
471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  30.87 
 
 
471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  31.49 
 
 
488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  30.82 
 
 
471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  29.09 
 
 
467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  32.46 
 
 
474 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  30.82 
 
 
471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  28.2 
 
 
471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  30.82 
 
 
471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  29.09 
 
 
467 aa  173  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  30.29 
 
 
500 aa  173  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  32.67 
 
 
473 aa  173  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  28.88 
 
 
467 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  32.37 
 
 
461 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  33.09 
 
 
413 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  31.9 
 
 
493 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  30.36 
 
 
455 aa  171  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  28.66 
 
 
467 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  30.15 
 
 
471 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  30 
 
 
471 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  30 
 
 
471 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  32.39 
 
 
482 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  30.13 
 
 
486 aa  171  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0084  amino acid permease-associated region  33.5 
 
 
449 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.687355  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  30.6 
 
 
485 aa  170  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  33.16 
 
 
425 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  29.42 
 
 
471 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  29.79 
 
 
471 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 
496 aa  169  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 
496 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  29.34 
 
 
495 aa  169  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  28.9 
 
 
549 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 
494 aa  167  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  30.24 
 
 
496 aa  167  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 
491 aa  166  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  31.88 
 
 
506 aa  166  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  30.75 
 
 
475 aa  166  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.300075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>