More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0621 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0232  amino acid permease family protein  84.99 
 
 		 496 aa  836    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0621  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 494 aa  985    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0607  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 494 aa  985    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21570  amino acid transporter  44.24 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.393168  hitchhiker  0.00168939 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0221  amino acid permease-associated region  38.27 
 
 		 490 aa  347  4e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0974  amino acid permease-associated region  37.01 
 
 		 502 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0717  amino acid permease family protein  33.41 
 
 		 443 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0730  amino acid permease family protein  33.56 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  33.54 
 
 		 480 aa  229  9e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  32.7 
 
 		 480 aa  228  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  31.28 
 
 		 468 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0152  amino acid permease family protein  32.36 
 
 		 451 aa  218  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.237797  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  29.61 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1531  amino acid permease-associated region  30.53 
 
 		 479 aa  211  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  31.38 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20300  amino acid transporter  27.15 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.533363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0244  amino acid permease-associated region  26.94 
 
 		 475 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.912876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1276  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3189  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22930  amino acid transporter  25.57 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0974202 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 482 aa  97.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 482 aa  97.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 		 496 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 		 496 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 518 aa  96.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 500 aa  95.9  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  24.9 
 
 		 566 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  22.79 
 
 		 486 aa  94  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  25.95 
 
 		 549 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 510 aa  93.6  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 454 aa  93.2  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 786 aa  92  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 		 495 aa  91.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  25.8 
 
 		 486 aa  91.3  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  24.64 
 
 		 440 aa  91.3  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  25.8 
 
 		 486 aa  91.3  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  22.67 
 
 		 465 aa  90.5  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  25.81 
 
 		 465 aa  90.5  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 466 aa  90.1  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 		 549 aa  90.1  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  26.86 
 
 		 483 aa  89  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  23.55 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 		 516 aa  88.2  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 501 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  24.11 
 
 		 489 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 770 aa  87.4  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 		 473 aa  87  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  24.25 
 
 		 483 aa  87  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 496 aa  86.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  22.95 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  24.84 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  27.3 
 
 		 542 aa  83.6  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  23.08 
 
 		 480 aa  82.8  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  23.17 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  25.87 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  24.86 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  23.51 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  24.24 
 
 		 467 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  25.76 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 527 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  28.49 
 
 		 753 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  21.63 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 716 aa  77  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  22.13 
 
 		 764 aa  76.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  23.71 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  24.81 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  23.09 
 
 		 494 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  23.65 
 
 		 486 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  23.66 
 
 		 495 aa  76.6  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  26.46 
 
 		 465 aa  76.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  22.63 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  23.65 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  22.63 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.56 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  24.7 
 
 		 538 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  23.28 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.89 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.89 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.89 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  24.29 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  25.57 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  22.42 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  22.42 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  22.42 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  22.42 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  23.57 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  22.42 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>