More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0195 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  62.83 
 
 
786 aa  905    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  100 
 
 
745 aa  1476    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  54.57 
 
 
764 aa  759    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  50 
 
 
820 aa  680    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  62.2 
 
 
770 aa  905    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  36.14 
 
 
792 aa  398  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  44.15 
 
 
474 aa  313  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  32.23 
 
 
716 aa  312  2e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  42.89 
 
 
473 aa  311  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  31.35 
 
 
753 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  42.98 
 
 
475 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  28.91 
 
 
773 aa  279  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  41.18 
 
 
479 aa  274  4.0000000000000004e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  33.23 
 
 
725 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  31.7 
 
 
740 aa  268  4e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  50.36 
 
 
625 aa  259  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  50.72 
 
 
732 aa  258  4e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  35.28 
 
 
641 aa  251  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  35.14 
 
 
465 aa  247  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  46.76 
 
 
604 aa  223  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 
796 aa  172  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1905  amino acid permease-associated region  27.51 
 
 
812 aa  164  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  31.66 
 
 
486 aa  153  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 
476 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 
439 aa  146  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  29.6 
 
 
494 aa  145  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 
455 aa  145  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  29.15 
 
 
506 aa  143  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.91 
 
 
476 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  30.47 
 
 
465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.71 
 
 
471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.71 
 
 
471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  29.88 
 
 
422 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  26.92 
 
 
471 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 
465 aa  140  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  29.29 
 
 
495 aa  140  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  26.92 
 
 
471 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  28.82 
 
 
495 aa  138  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  29.93 
 
 
485 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 
469 aa  137  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 
485 aa  136  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  30 
 
 
468 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 
500 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.61 
 
 
476 aa  135  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  26.91 
 
 
471 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  26.91 
 
 
471 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  26.91 
 
 
471 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.37 
 
 
471 aa  134  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 
518 aa  134  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  27.03 
 
 
471 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.16 
 
 
471 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 
549 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.94 
 
 
471 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.94 
 
 
471 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.94 
 
 
471 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.94 
 
 
471 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.94 
 
 
471 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  26.43 
 
 
471 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 
471 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  26.04 
 
 
503 aa  131  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 
495 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  31.44 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 
456 aa  130  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 
471 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.42 
 
 
489 aa  129  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  25.86 
 
 
476 aa  128  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  30.79 
 
 
474 aa  127  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 
494 aa  127  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 
496 aa  127  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 
496 aa  127  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  29.48 
 
 
538 aa  127  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 
488 aa  126  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  27.01 
 
 
486 aa  125  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  24.4 
 
 
467 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  24.24 
 
 
467 aa  125  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  24.4 
 
 
467 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 
482 aa  125  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  24.45 
 
 
467 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  27.61 
 
 
471 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 
488 aa  125  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  27.84 
 
 
471 aa  125  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  24.24 
 
 
467 aa  124  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  27.84 
 
 
471 aa  124  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  26.8 
 
 
462 aa  124  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  24.24 
 
 
467 aa  124  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  28.21 
 
 
460 aa  124  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  23.85 
 
 
467 aa  124  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  24.74 
 
 
566 aa  124  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 
501 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  27.38 
 
 
471 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  25.83 
 
 
471 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  29.72 
 
 
463 aa  123  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.91 
 
 
436 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  30.84 
 
 
481 aa  123  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 
491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  23.97 
 
 
483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  26.91 
 
 
471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  29.01 
 
 
476 aa  121  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 
476 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  28.54 
 
 
483 aa  121  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>