More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3284 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  100 
 
 
503 aa  1003    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  49.12 
 
 
490 aa  475  1e-133  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  52.86 
 
 
496 aa  472  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  52.86 
 
 
496 aa  472  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  48.29 
 
 
495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  49.9 
 
 
566 aa  462  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  48.94 
 
 
494 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  48.85 
 
 
495 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  51.51 
 
 
478 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  52.96 
 
 
496 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  50.1 
 
 
497 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  51.38 
 
 
486 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  49.5 
 
 
549 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  47.71 
 
 
495 aa  444  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  50.5 
 
 
481 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  49.31 
 
 
482 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  49.51 
 
 
496 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  50.1 
 
 
486 aa  430  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  48.67 
 
 
501 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  47.41 
 
 
476 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  46.64 
 
 
496 aa  422  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  46.41 
 
 
471 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  46.64 
 
 
483 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  43.21 
 
 
489 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  49.6 
 
 
480 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  45.73 
 
 
476 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  44.58 
 
 
463 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  44.38 
 
 
463 aa  415  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  45.23 
 
 
488 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  51.08 
 
 
489 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  45.83 
 
 
502 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  50.51 
 
 
517 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  46.33 
 
 
486 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  46.33 
 
 
486 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  44.99 
 
 
492 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  50.49 
 
 
494 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  43.94 
 
 
476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  44.64 
 
 
476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  43.14 
 
 
506 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  46.18 
 
 
466 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  45.78 
 
 
468 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  46.96 
 
 
481 aa  395  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  46.18 
 
 
466 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  45.78 
 
 
468 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  44.42 
 
 
471 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  44.42 
 
 
471 aa  395  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  44.42 
 
 
471 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  46.39 
 
 
467 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  45.78 
 
 
466 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  44.42 
 
 
471 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  46.39 
 
 
467 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  46.39 
 
 
467 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  45.78 
 
 
468 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  46.39 
 
 
467 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  46.82 
 
 
517 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  45.78 
 
 
468 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  45.98 
 
 
467 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  45.98 
 
 
467 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  45.98 
 
 
467 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  45.98 
 
 
467 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  45.98 
 
 
466 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  44.15 
 
 
465 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  46.14 
 
 
491 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  43.54 
 
 
495 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  43.5 
 
 
467 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  45.4 
 
 
463 aa  382  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  42.83 
 
 
467 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  43.29 
 
 
467 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  43.5 
 
 
467 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  42.54 
 
 
465 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  43.29 
 
 
467 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  43.29 
 
 
467 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  41.88 
 
 
468 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  43.2 
 
 
469 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  43.05 
 
 
491 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  43.29 
 
 
467 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  45.69 
 
 
463 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  42.02 
 
 
500 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  43.29 
 
 
467 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  43.83 
 
 
467 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  43.55 
 
 
518 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  43.12 
 
 
467 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  43.58 
 
 
486 aa  369  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0344  amino acid permease family protein  47.84 
 
 
465 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1676  amino acid permease-associated region  44.81 
 
 
469 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.047453  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  43.35 
 
 
501 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  42.43 
 
 
460 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  43.72 
 
 
473 aa  359  6e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  44.33 
 
 
475 aa  359  7e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  43.23 
 
 
464 aa  359  8e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  39.96 
 
 
463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  44.21 
 
 
438 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  45.33 
 
 
468 aa  356  6.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  43.69 
 
 
476 aa  355  7.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  43.69 
 
 
476 aa  355  7.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  42.88 
 
 
478 aa  351  2e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  42.38 
 
 
456 aa  350  5e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  40.53 
 
 
513 aa  347  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  41.14 
 
 
510 aa  347  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  42.41 
 
 
477 aa  347  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>