More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0250 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  78.57 
 
 		 476 aa  725    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 465 aa  918    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  88.74 
 
 		 465 aa  806    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  73.04 
 
 		 466 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  71.77 
 
 		 468 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  72.41 
 
 		 468 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  72.2 
 
 		 467 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  79.87 
 
 		 476 aa  744    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  80.09 
 
 		 476 aa  760    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  90.54 
 
 		 469 aa  822    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  71.77 
 
 		 468 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  72.39 
 
 		 466 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  72.61 
 
 		 466 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  72.84 
 
 		 466 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  71.77 
 
 		 468 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  71.77 
 
 		 467 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  71.77 
 
 		 467 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  71.77 
 
 		 467 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  72.14 
 
 		 463 aa  632  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  71.34 
 
 		 467 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  71.34 
 
 		 467 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  71.34 
 
 		 467 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  71.34 
 
 		 467 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  73 
 
 		 463 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  60.65 
 
 		 476 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  58.01 
 
 		 471 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  58.01 
 
 		 471 aa  526  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  57.36 
 
 		 471 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  57.58 
 
 		 471 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  59.57 
 
 		 471 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  53.93 
 
 		 486 aa  489  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  51.93 
 
 		 471 aa  487  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  51.29 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  51.29 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  51.29 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  51.29 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  52.48 
 
 		 467 aa  482  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  51.07 
 
 		 471 aa  482  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  51.29 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  51.29 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  51.4 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  51.07 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  52.48 
 
 		 467 aa  481  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  52.27 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  52.48 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  52.27 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  52.27 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  52.7 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  52.27 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  52.05 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  51.84 
 
 		 467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  52.23 
 
 		 478 aa  468  1.0000000000000001e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  51.29 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  54.55 
 
 		 481 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  52.04 
 
 		 460 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  47.3 
 
 		 471 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  47.3 
 
 		 471 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  47.3 
 
 		 471 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  49.89 
 
 		 467 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  48.43 
 
 		 490 aa  449  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  47.3 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  48.05 
 
 		 489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  51.63 
 
 		 488 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  49.46 
 
 		 506 aa  440  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  47.05 
 
 		 495 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  47.08 
 
 		 471 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  53.25 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  49.89 
 
 		 482 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  47.08 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  46.87 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  46.65 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  46.87 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  49.9 
 
 		 492 aa  428  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  53.45 
 
 		 506 aa  424  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  47.95 
 
 		 495 aa  419  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  48.06 
 
 		 494 aa  421  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  44.94 
 
 		 486 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  49.04 
 
 		 500 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  45.17 
 
 		 549 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  49.03 
 
 		 518 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  51.22 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  50.22 
 
 		 491 aa  411  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  49.79 
 
 		 486 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  53.36 
 
 		 468 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  48.88 
 
 		 497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  46.31 
 
 		 495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  43.78 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  44.58 
 
 		 566 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  43.78 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  46.67 
 
 		 463 aa  403  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  45.62 
 
 		 496 aa  403  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  49.59 
 
 		 517 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  46.45 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  45.76 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  47.48 
 
 		 480 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  45.42 
 
 		 483 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  43.55 
 
 		 503 aa  395  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  46.94 
 
 		 504 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  46.29 
 
 		 486 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  43.8 
 
 		 496 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>