More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2013 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 501 aa  985    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  64.14 
 
 		 489 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  62.85 
 
 		 500 aa  594  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  61.79 
 
 		 492 aa  546  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  62.4 
 
 		 495 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  60.91 
 
 		 504 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  56.61 
 
 		 512 aa  525  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  59.22 
 
 		 491 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  54.69 
 
 		 476 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  58.13 
 
 		 503 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  60.33 
 
 		 500 aa  513  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  54.71 
 
 		 471 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  57.72 
 
 		 517 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4164  amino acid permease-associated region  57.12 
 
 		 537 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.696427  normal  0.49431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  53.41 
 
 		 513 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  55.53 
 
 		 499 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  53.23 
 
 		 476 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  53.94 
 
 		 516 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4360  amino acid permease-associated region  55.06 
 
 		 686 aa  487  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120164  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  56.73 
 
 		 503 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  51.61 
 
 		 471 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  52.92 
 
 		 476 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  51.81 
 
 		 471 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  51.61 
 
 		 471 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  51.81 
 
 		 471 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1740  amino acid permease-associated region  57.38 
 
 		 493 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  49.8 
 
 		 467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  50 
 
 		 467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  49.8 
 
 		 467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  51.49 
 
 		 476 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  50 
 
 		 467 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  49.8 
 
 		 467 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  50 
 
 		 467 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  49 
 
 		 506 aa  468  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  50 
 
 		 467 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  49.8 
 
 		 467 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  49.8 
 
 		 467 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  53.25 
 
 		 465 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  47 
 
 		 496 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  52 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  47 
 
 		 496 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  52.11 
 
 		 468 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  49.8 
 
 		 467 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  48.9 
 
 		 495 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1368  amino acid permease-associated region  55.38 
 
 		 490 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1332  amino acid permease-associated region  55.38 
 
 		 490 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  46.92 
 
 		 496 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  52.02 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  45.95 
 
 		 490 aa  456  1e-127  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1349  amino acid permease-associated region  55.38 
 
 		 490 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.923637  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  48.78 
 
 		 463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  51.61 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  48.78 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  51.41 
 
 		 465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  52.02 
 
 		 466 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  51.51 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  54.02 
 
 		 481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  51.61 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  50.4 
 
 		 482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  51.51 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  49.6 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  49.07 
 
 		 468 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  48.69 
 
 		 494 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  45.4 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  45.4 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  45.4 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  45.6 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  49.02 
 
 		 495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  45.4 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  45.6 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  45.4 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  48.27 
 
 		 520 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  45.09 
 
 		 471 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  51.11 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  51.11 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  44.8 
 
 		 471 aa  442  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  51.31 
 
 		 467 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  47.69 
 
 		 483 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  51.51 
 
 		 467 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  51.31 
 
 		 467 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  51.11 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  51.11 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  47.86 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  51.31 
 
 		 467 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  49.36 
 
 		 518 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0344  amino acid permease family protein  53.89 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  45 
 
 		 471 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  47.48 
 
 		 496 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  48.48 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  49.8 
 
 		 496 aa  435  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  49.7 
 
 		 486 aa  438  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  50.51 
 
 		 466 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  49.49 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  50.61 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  49.09 
 
 		 478 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  45.47 
 
 		 549 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  43.66 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  46.09 
 
 		 486 aa  428  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  45.04 
 
 		 486 aa  431  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  46.83 
 
 		 491 aa  429  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>