More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6322 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  70.99 
 
 		 516 aa  674    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  68.23 
 
 		 503 aa  643    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 503 aa  986    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  72.46 
 
 		 512 aa  721    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  68.08 
 
 		 513 aa  628  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1740  amino acid permease-associated region  70.08 
 
 		 493 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1332  amino acid permease-associated region  71.54 
 
 		 490 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1368  amino acid permease-associated region  71.54 
 
 		 490 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1349  amino acid permease-associated region  71.54 
 
 		 490 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.923637  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  67.14 
 
 		 499 aa  618  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4360  amino acid permease-associated region  66.6 
 
 		 686 aa  611  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120164  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13282  cationic amino acid transport integral membrane protein  65.19 
 
 		 495 aa  599  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.260226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4164  amino acid permease-associated region  64.55 
 
 		 537 aa  585  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.696427  normal  0.49431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  57.52 
 
 		 489 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  58.45 
 
 		 521 aa  548  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  54.58 
 
 		 515 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  58.12 
 
 		 500 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  55.89 
 
 		 515 aa  531  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  54.02 
 
 		 520 aa  524  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  59.11 
 
 		 501 aa  491  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  56.73 
 
 		 492 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  55.82 
 
 		 495 aa  483  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  55.35 
 
 		 500 aa  483  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1683  amino acid transporter  50.81 
 
 		 508 aa  476  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000204712  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  56.09 
 
 		 504 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0241  amino acid permease  51.02 
 
 		 543 aa  474  1e-132  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  55.78 
 
 		 491 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  54.81 
 
 		 517 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  47.26 
 
 		 476 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  45.04 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  48.59 
 
 		 471 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  46.84 
 
 		 494 aa  415  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  45.44 
 
 		 476 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  44.55 
 
 		 495 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  44.69 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  45.33 
 
 		 476 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  45 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  41.81 
 
 		 496 aa  395  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  41.81 
 
 		 496 aa  395  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  45.12 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  40.79 
 
 		 490 aa  391  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  43.26 
 
 		 467 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  43.06 
 
 		 467 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  43.26 
 
 		 467 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  43.26 
 
 		 467 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  45.09 
 
 		 468 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  43.82 
 
 		 495 aa  387  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  43.06 
 
 		 467 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  42.43 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  42.32 
 
 		 549 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  43.95 
 
 		 465 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  43.06 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  43.29 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  42.27 
 
 		 566 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  43.46 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  44.55 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  43.06 
 
 		 467 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  44.18 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  42.2 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  43.5 
 
 		 467 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  44.78 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  41.2 
 
 		 506 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  44.38 
 
 		 468 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  43.98 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  44.78 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  44.38 
 
 		 468 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  41.62 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  41.62 
 
 		 463 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  47.65 
 
 		 497 aa  376  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  44.78 
 
 		 466 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  42.83 
 
 		 486 aa  378  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  43.46 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  44.82 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  42.74 
 
 		 481 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  41.41 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  41.53 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  41.53 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  41.53 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  41.53 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  41.53 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  42.06 
 
 		 486 aa  371  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  41.53 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  42.23 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  44.74 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  42.23 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  44.38 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  40.6 
 
 		 488 aa  365  1e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  44.33 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  41.62 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  44.33 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  44.33 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  44.33 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  42.16 
 
 		 502 aa  363  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  44.33 
 
 		 467 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  44.33 
 
 		 467 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  44.33 
 
 		 467 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  43.49 
 
 		 481 aa  363  5.0000000000000005e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  42.4 
 
 		 471 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  42.4 
 
 		 471 aa  362  8e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  40.24 
 
 		 471 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>