More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0096 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  73.88 
 
 		 476 aa  694    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  85.19 
 
 		 467 aa  764    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  85.19 
 
 		 467 aa  764    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  86.15 
 
 		 468 aa  781    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  72.84 
 
 		 465 aa  666    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  71.61 
 
 		 465 aa  658    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  85.62 
 
 		 467 aa  766    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  92.44 
 
 		 463 aa  765    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  86.36 
 
 		 468 aa  781    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  85.41 
 
 		 467 aa  764    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  92.42 
 
 		 463 aa  783    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  85.62 
 
 		 467 aa  766    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  71.98 
 
 		 469 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  77.8 
 
 		 476 aa  733    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  86.15 
 
 		 468 aa  783    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  85.06 
 
 		 466 aa  771    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  85.62 
 
 		 467 aa  766    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  85.28 
 
 		 466 aa  773    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 466 aa  917    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  76.72 
 
 		 476 aa  707    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  86.15 
 
 		 468 aa  783    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  84.63 
 
 		 466 aa  765    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  85.19 
 
 		 467 aa  764    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  85.19 
 
 		 467 aa  764    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  58.8 
 
 		 471 aa  534  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  61.08 
 
 		 476 aa  531  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  58.8 
 
 		 471 aa  534  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  58.37 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  58.37 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  59.49 
 
 		 471 aa  521  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  55.97 
 
 		 467 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  55.53 
 
 		 467 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  55.75 
 
 		 467 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  55.53 
 
 		 467 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  55.75 
 
 		 467 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  55.75 
 
 		 467 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  55.75 
 
 		 467 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  55.31 
 
 		 467 aa  498  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  55.1 
 
 		 467 aa  495  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  55.1 
 
 		 467 aa  495  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  51.72 
 
 		 471 aa  488  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  51.72 
 
 		 471 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  51.72 
 
 		 471 aa  488  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  51.72 
 
 		 471 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  52.58 
 
 		 471 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  51.72 
 
 		 471 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  51.72 
 
 		 471 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  51.72 
 
 		 471 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  52.36 
 
 		 471 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  51.53 
 
 		 489 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  51.72 
 
 		 471 aa  488  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  52.58 
 
 		 471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  50.1 
 
 		 486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  51.5 
 
 		 460 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  49.46 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  49.46 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  50.11 
 
 		 478 aa  459  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  49.46 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  48.71 
 
 		 471 aa  455  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  53.9 
 
 		 481 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  49.09 
 
 		 495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  49.24 
 
 		 471 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  49.24 
 
 		 471 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  49.68 
 
 		 471 aa  441  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  50.51 
 
 		 492 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  50.95 
 
 		 482 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  49.03 
 
 		 471 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  48.81 
 
 		 471 aa  438  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  49.57 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  49.57 
 
 		 463 aa  435  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  52.94 
 
 		 495 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  53.48 
 
 		 517 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  48.18 
 
 		 467 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  50.83 
 
 		 486 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  48.93 
 
 		 506 aa  433  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  49.14 
 
 		 488 aa  428  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  49.69 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  48.58 
 
 		 500 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  50.51 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  47.18 
 
 		 490 aa  425  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  47.06 
 
 		 486 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  49.49 
 
 		 495 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  49.39 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  48.93 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  46.56 
 
 		 496 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  46.71 
 
 		 468 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  45.18 
 
 		 503 aa  408  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  48.9 
 
 		 504 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  50 
 
 		 500 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  49.9 
 
 		 497 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  48.04 
 
 		 495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  48.65 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  44.4 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  47.37 
 
 		 476 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  50.11 
 
 		 506 aa  405  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  44.4 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  47.37 
 
 		 476 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  46.14 
 
 		 483 aa  405  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  45.97 
 
 		 486 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  45.97 
 
 		 486 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>