More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1168 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  100 
 
 
478 aa  950    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  72.08 
 
 
486 aa  708    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  53.26 
 
 
476 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  53.18 
 
 
476 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  53.29 
 
 
465 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  50.62 
 
 
476 aa  477  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  51.26 
 
 
469 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  52.23 
 
 
465 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  50.11 
 
 
466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  51.04 
 
 
471 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  50.42 
 
 
471 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  50.83 
 
 
471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  50.42 
 
 
471 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  50.11 
 
 
468 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  50.53 
 
 
466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  49.68 
 
 
468 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  50.11 
 
 
468 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  50.32 
 
 
466 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  50.32 
 
 
466 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  50.11 
 
 
468 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  50.21 
 
 
467 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  49.58 
 
 
467 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  49.58 
 
 
467 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  49.79 
 
 
463 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  49.58 
 
 
467 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  47.58 
 
 
467 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  47.37 
 
 
467 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  47.37 
 
 
467 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  49.37 
 
 
467 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  49.37 
 
 
467 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  49.37 
 
 
467 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  49.37 
 
 
467 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  47.16 
 
 
467 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  47.16 
 
 
467 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  47.16 
 
 
467 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  47.16 
 
 
467 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  48 
 
 
467 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  47.7 
 
 
467 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  48.95 
 
 
476 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  45.23 
 
 
490 aa  422  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  47.79 
 
 
467 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  49.58 
 
 
463 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  47.51 
 
 
471 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  45.42 
 
 
495 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  44.61 
 
 
471 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  48.31 
 
 
460 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  44.89 
 
 
471 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  44.38 
 
 
471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  44.38 
 
 
471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  44.38 
 
 
471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  44.58 
 
 
471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  44.61 
 
 
471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  44.38 
 
 
471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  44.58 
 
 
471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  44.38 
 
 
471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  47.35 
 
 
494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  42.89 
 
 
489 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  45.64 
 
 
495 aa  393  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  43.18 
 
 
496 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  45.53 
 
 
495 aa  391  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  44.79 
 
 
471 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  43.18 
 
 
496 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  43.15 
 
 
471 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  43.15 
 
 
471 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  43.15 
 
 
471 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  45.65 
 
 
482 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  41.91 
 
 
471 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  44.35 
 
 
463 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  43.04 
 
 
467 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  44.14 
 
 
463 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  42.28 
 
 
486 aa  381  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  43.15 
 
 
492 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  47.07 
 
 
497 aa  378  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  47.05 
 
 
486 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  43.18 
 
 
496 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  43.15 
 
 
471 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  43.29 
 
 
501 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  43.97 
 
 
500 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  44.77 
 
 
488 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  43.36 
 
 
471 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  43.15 
 
 
471 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  42.95 
 
 
471 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  42.74 
 
 
471 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  45.96 
 
 
468 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  47.12 
 
 
517 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  47.23 
 
 
481 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  48.08 
 
 
501 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  44.21 
 
 
549 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  41.19 
 
 
506 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  42.83 
 
 
566 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  44.33 
 
 
480 aa  363  3e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  44.33 
 
 
486 aa  361  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  44.33 
 
 
486 aa  361  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  42.92 
 
 
466 aa  359  5e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  42.55 
 
 
473 aa  358  8e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  42.98 
 
 
478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  42.11 
 
 
503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  42.39 
 
 
496 aa  355  6.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  45.15 
 
 
495 aa  354  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  42.08 
 
 
502 aa  353  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.892102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>