More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4455 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 496 aa  993    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  95.77 
 
 		 496 aa  940    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 496 aa  993    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  63.33 
 
 		 486 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  57.06 
 
 		 549 aa  552  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2013  amino acid permease-associated region  76.17 
 
 		 461 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0847443  normal  0.208384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  58.66 
 
 		 478 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  58.28 
 
 		 481 aa  545  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  55.94 
 
 		 566 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  57.41 
 
 		 480 aa  539  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  55.44 
 
 		 501 aa  518  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  49.28 
 
 		 490 aa  494  9.999999999999999e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  51.45 
 
 		 482 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  53.62 
 
 		 486 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  52.86 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  48.36 
 
 		 486 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  48.36 
 
 		 486 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  47.08 
 
 		 495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  48.97 
 
 		 496 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  48.97 
 
 		 483 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  43.89 
 
 		 489 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  46.84 
 
 		 495 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  44.88 
 
 		 500 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  47.97 
 
 		 496 aa  428  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  45.27 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  46.45 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  49.89 
 
 		 491 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  49.05 
 
 		 464 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  46.28 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  47 
 
 		 501 aa  415  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  46.83 
 
 		 495 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  47.93 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  49.8 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  46.68 
 
 		 497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  45.58 
 
 		 492 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  46.17 
 
 		 517 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  45.75 
 
 		 502 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  47.86 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  48.71 
 
 		 475 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  47.86 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  46.2 
 
 		 471 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  45.21 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  46.85 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  45 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  44.51 
 
 		 488 aa  395  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  44.49 
 
 		 471 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  44.69 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  42.86 
 
 		 476 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  44.49 
 
 		 471 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  44.69 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  43.78 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  45.64 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  42.47 
 
 		 506 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  45.02 
 
 		 466 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  45.3 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  45.85 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  45.53 
 
 		 466 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  45.3 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  42.09 
 
 		 513 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  45.3 
 
 		 468 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  46.79 
 
 		 488 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  43.06 
 
 		 476 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  45.11 
 
 		 504 aa  388  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  42.74 
 
 		 476 aa  385  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  47.98 
 
 		 517 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  45.23 
 
 		 467 aa  382  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  44.81 
 
 		 473 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  40.94 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  44.61 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  43.19 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  43.09 
 
 		 486 aa  378  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  43.19 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  42.71 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  47.46 
 
 		 489 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  42.98 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  44.61 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  44.61 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  44.81 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  43.19 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  43.51 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  44.61 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  44.81 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  44.81 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  42.92 
 
 		 467 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  42.77 
 
 		 467 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  42.59 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4398  amino acid permease-associated region  46.89 
 
 		 488 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  43.82 
 
 		 467 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  43.18 
 
 		 478 aa  372  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  39.53 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  42.36 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  45.67 
 
 		 477 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  43.19 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  43.19 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4360  amino acid permease-associated region  44.29 
 
 		 686 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120164  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  41.81 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  44.4 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1409  cationic amino acid transporter  45.05 
 
 		 464 aa  372  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.173334  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 516 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  41.49 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>