More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0207 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  71.15 
 
 		 466 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  77.92 
 
 		 476 aa  714    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  79.23 
 
 		 476 aa  739    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  71.03 
 
 		 466 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  90.54 
 
 		 465 aa  822    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  87.01 
 
 		 465 aa  787    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  71.98 
 
 		 466 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  71.15 
 
 		 468 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 469 aa  932    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  71.34 
 
 		 468 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  79.44 
 
 		 476 aa  753    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  70.82 
 
 		 466 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  71.34 
 
 		 468 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  71.34 
 
 		 468 aa  648    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  70.73 
 
 		 467 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  70.73 
 
 		 467 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  70.73 
 
 		 467 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  70.3 
 
 		 467 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  70.3 
 
 		 467 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  70.51 
 
 		 467 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  70.3 
 
 		 467 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  70.3 
 
 		 467 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  70.63 
 
 		 463 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  71.27 
 
 		 463 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  59.57 
 
 		 476 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  56.41 
 
 		 471 aa  518  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  56.41 
 
 		 471 aa  518  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  58.81 
 
 		 471 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  56.2 
 
 		 471 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  56.2 
 
 		 471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  53.32 
 
 		 486 aa  496  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  52.78 
 
 		 467 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  52.56 
 
 		 467 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  52.56 
 
 		 467 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  52.56 
 
 		 467 aa  488  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  52.56 
 
 		 467 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  52.35 
 
 		 467 aa  485  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  52.56 
 
 		 467 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  52.35 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  49.47 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  49.47 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  49.47 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  49.25 
 
 		 471 aa  482  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  52.56 
 
 		 467 aa  484  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  50 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  49.47 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  49.25 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  49.47 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  49.79 
 
 		 471 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  52.35 
 
 		 467 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  49.25 
 
 		 471 aa  480  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  51.26 
 
 		 478 aa  473  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  49.47 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  51.61 
 
 		 460 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  47.69 
 
 		 489 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  47.73 
 
 		 471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  47.73 
 
 		 471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  47.73 
 
 		 471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  47.52 
 
 		 471 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  54.27 
 
 		 481 aa  450  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  50.32 
 
 		 467 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  48.85 
 
 		 490 aa  445  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  49.25 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  47.66 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  50.42 
 
 		 482 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  47.52 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  47.3 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  47.52 
 
 		 471 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  47.08 
 
 		 471 aa  435  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  47.3 
 
 		 471 aa  435  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  52 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  49.28 
 
 		 492 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  48.16 
 
 		 495 aa  423  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  50.54 
 
 		 488 aa  423  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  50.52 
 
 		 517 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  53.36 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  44.73 
 
 		 486 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  44.76 
 
 		 549 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  47.01 
 
 		 500 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  51.22 
 
 		 495 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  47.03 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  47.22 
 
 		 463 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  51.72 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  46.82 
 
 		 468 aa  411  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  48.09 
 
 		 518 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  50.66 
 
 		 491 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  50.54 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  47.01 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  48.78 
 
 		 497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  45.9 
 
 		 495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  43.4 
 
 		 566 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  47.5 
 
 		 504 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  47.4 
 
 		 496 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  47.78 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  42.59 
 
 		 496 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  46.43 
 
 		 480 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  46.51 
 
 		 486 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  42.59 
 
 		 496 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  46.51 
 
 		 486 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  44.69 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>