More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1720 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  100 
 
 
471 aa  934    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  89.36 
 
 
476 aa  807    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  62.34 
 
 
471 aa  580  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  62.34 
 
 
471 aa  580  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  62.13 
 
 
471 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  62.13 
 
 
471 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  60.13 
 
 
476 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  57.57 
 
 
467 aa  546  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  56.93 
 
 
467 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  56.93 
 
 
467 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  56.93 
 
 
467 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  56.62 
 
 
467 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  56.93 
 
 
467 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  56.72 
 
 
467 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  56.93 
 
 
467 aa  536  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  58.81 
 
 
469 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  56.84 
 
 
467 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  59.57 
 
 
465 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  56.41 
 
 
467 aa  532  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  59.27 
 
 
476 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  59.19 
 
 
476 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  54.06 
 
 
471 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  54.06 
 
 
471 aa  529  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  53.42 
 
 
471 aa  525  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  53.42 
 
 
471 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  53.42 
 
 
471 aa  525  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  53.63 
 
 
471 aa  526  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  57.91 
 
 
465 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  53.42 
 
 
471 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  53.42 
 
 
471 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  53.63 
 
 
471 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  53.63 
 
 
471 aa  524  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  59.57 
 
 
468 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  58.92 
 
 
468 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  59.49 
 
 
466 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  59.83 
 
 
466 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  59.83 
 
 
466 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  58.92 
 
 
468 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  58.92 
 
 
468 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  56.56 
 
 
460 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  58.28 
 
 
466 aa  512  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  58.94 
 
 
467 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  58.94 
 
 
467 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  59.15 
 
 
467 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  59.15 
 
 
467 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  58.94 
 
 
467 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  59.15 
 
 
467 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  58.94 
 
 
467 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  58.94 
 
 
467 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  53.21 
 
 
471 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  59.57 
 
 
463 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  51.82 
 
 
495 aa  498  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  54.18 
 
 
494 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  50 
 
 
471 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  50 
 
 
471 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  50 
 
 
471 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  50.41 
 
 
489 aa  491  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  50.43 
 
 
471 aa  487  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  54.27 
 
 
495 aa  487  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  59.57 
 
 
463 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  54.71 
 
 
501 aa  484  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  48.55 
 
 
490 aa  481  1e-134  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  52.24 
 
 
506 aa  479  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  50.43 
 
 
471 aa  475  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  50.21 
 
 
471 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  49.79 
 
 
471 aa  475  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  50 
 
 
471 aa  476  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  49.79 
 
 
471 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  51.16 
 
 
467 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  57.08 
 
 
481 aa  474  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  51.93 
 
 
495 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  52.22 
 
 
496 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  52.65 
 
 
497 aa  463  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  51.19 
 
 
463 aa  461  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  51.19 
 
 
463 aa  461  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  53.29 
 
 
488 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  51.32 
 
 
492 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  53.26 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  55.65 
 
 
468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  50.43 
 
 
468 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  50.52 
 
 
496 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  48.28 
 
 
500 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  52.08 
 
 
517 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  52.34 
 
 
495 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  49.89 
 
 
518 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  49.9 
 
 
483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  51.78 
 
 
486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  50.1 
 
 
486 aa  443  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  47.62 
 
 
549 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  49.59 
 
 
486 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  49.59 
 
 
486 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  49.1 
 
 
504 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  46.2 
 
 
496 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1676  amino acid permease-associated region  52.95 
 
 
469 aa  432  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.047453  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  51.43 
 
 
500 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  46.41 
 
 
503 aa  433  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  46.2 
 
 
496 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0344  amino acid permease family protein  54.56 
 
 
465 aa  430  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  47.3 
 
 
463 aa  431  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  47.73 
 
 
478 aa  428  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>