More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1676 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1676  amino acid permease-associated region  100 
 
 
469 aa  921    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.047453  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0344  amino acid permease family protein  74.08 
 
 
465 aa  597  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  65.38 
 
 
468 aa  586  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  57.08 
 
 
463 aa  517  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  56.87 
 
 
463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  52.95 
 
 
471 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  53.68 
 
 
476 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  56.29 
 
 
468 aa  458  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  53.18 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  53.18 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  52.97 
 
 
471 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  52.97 
 
 
471 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  50.84 
 
 
476 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  54.99 
 
 
481 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  50.21 
 
 
476 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  49.48 
 
 
476 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  49.57 
 
 
471 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  49.57 
 
 
471 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  49.14 
 
 
471 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  51.56 
 
 
467 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  49.14 
 
 
471 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  51.78 
 
 
467 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  49.14 
 
 
471 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  49.14 
 
 
471 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  51.78 
 
 
467 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  49.14 
 
 
471 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  51.56 
 
 
467 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  51.56 
 
 
467 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  51.33 
 
 
467 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  51.56 
 
 
467 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  51.56 
 
 
467 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  46.43 
 
 
495 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  45.6 
 
 
489 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  51.9 
 
 
467 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  51.16 
 
 
465 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  47.84 
 
 
471 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  49.26 
 
 
488 aa  422  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  49.37 
 
 
466 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  48.06 
 
 
471 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  50.64 
 
 
466 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  50 
 
 
468 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  50.21 
 
 
468 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  48.52 
 
 
506 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  50.64 
 
 
467 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  50.89 
 
 
467 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  49.26 
 
 
463 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  48.06 
 
 
471 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  50 
 
 
468 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  50.43 
 
 
466 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  50 
 
 
468 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  50 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  50.21 
 
 
467 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  50 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  50 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  49.57 
 
 
466 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  50 
 
 
465 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  50 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  50.21 
 
 
467 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  50.21 
 
 
467 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  47.13 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  47.63 
 
 
471 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  49.69 
 
 
469 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  51.54 
 
 
501 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  46.76 
 
 
490 aa  414  1e-114  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  49.47 
 
 
463 aa  412  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  44.81 
 
 
503 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  48.19 
 
 
495 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  51.08 
 
 
486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  48.39 
 
 
518 aa  402  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  46.78 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  46.78 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  46.65 
 
 
495 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  46.78 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  48.72 
 
 
460 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  48.8 
 
 
482 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  44.56 
 
 
471 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  46.09 
 
 
497 aa  392  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  46.36 
 
 
496 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  46.48 
 
 
467 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  47.32 
 
 
471 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  46.6 
 
 
500 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  46.88 
 
 
471 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  46.65 
 
 
471 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  46.15 
 
 
483 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  46.42 
 
 
492 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  46.43 
 
 
471 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  46.88 
 
 
471 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  47 
 
 
495 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  47.97 
 
 
496 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  43.6 
 
 
496 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  43.32 
 
 
486 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  43.32 
 
 
486 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  45.82 
 
 
491 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  43.6 
 
 
496 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  43.69 
 
 
549 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  45.95 
 
 
466 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  48.17 
 
 
517 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  44.62 
 
 
504 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  47.1 
 
 
481 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  45.07 
 
 
486 aa  370  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>