More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1640 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 463 aa  927    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  68.03 
 
 		 462 aa  624  1e-177  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  48.59 
 
 		 466 aa  443  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  49.78 
 
 		 465 aa  426  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  48.38 
 
 		 476 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  44.9 
 
 		 471 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  47.3 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  44.81 
 
 		 471 aa  418  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  44.03 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  43.82 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  43.82 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  45.43 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  43.82 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  44.03 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  45.87 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  43.82 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  45.43 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  43.82 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  45 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  43.17 
 
 		 471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  45.95 
 
 		 467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  45 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  45.22 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  44.57 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  44.78 
 
 		 467 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  45.89 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  45.89 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  47.01 
 
 		 476 aa  403  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  44.28 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  45.45 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  45.43 
 
 		 467 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  45.45 
 
 		 471 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  44.03 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  42.21 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  42.21 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  42.21 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  44.49 
 
 		 460 aa  388  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  41.21 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  40.73 
 
 		 489 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  44.13 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  43.63 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  43.17 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  41.77 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  43.99 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  41.99 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  42.21 
 
 		 471 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  41.99 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  42.21 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  43.78 
 
 		 466 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  43.35 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  43.78 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  43.35 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  43.35 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  42.76 
 
 		 476 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  43.31 
 
 		 482 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  42.68 
 
 		 486 aa  371  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  43.31 
 
 		 482 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  43.13 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  42.8 
 
 		 466 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  42.27 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  42.7 
 
 		 465 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  41.28 
 
 		 490 aa  362  8e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  47.56 
 
 		 427 aa  361  1e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  41.97 
 
 		 465 aa  360  4e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  43.32 
 
 		 467 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  43.32 
 
 		 467 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  43.32 
 
 		 467 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  43.32 
 
 		 467 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  43.32 
 
 		 467 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  43.32 
 
 		 467 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  43.32 
 
 		 467 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  43.1 
 
 		 467 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  40.99 
 
 		 465 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  39.84 
 
 		 500 aa  354  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  42.15 
 
 		 463 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  42.43 
 
 		 478 aa  348  1e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  40.62 
 
 		 506 aa  347  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  41.52 
 
 		 456 aa  346  4e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  41.96 
 
 		 483 aa  344  2e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  43.13 
 
 		 490 aa  344  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  42.24 
 
 		 486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  41.14 
 
 		 518 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  42.24 
 
 		 486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  41.72 
 
 		 496 aa  343  4e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  40.2 
 
 		 494 aa  342  9e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  39.58 
 
 		 496 aa  342  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  39.58 
 
 		 496 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  42.92 
 
 		 483 aa  341  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  43.43 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  42.98 
 
 		 483 aa  339  7e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  38.83 
 
 		 520 aa  338  8e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  40.09 
 
 		 463 aa  338  9e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  40.89 
 
 		 495 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  40.4 
 
 		 464 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  42.37 
 
 		 463 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 492 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  38.74 
 
 		 460 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  39.61 
 
 		 466 aa  335  9e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  41.14 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  38.23 
 
 		 515 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>