More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1683 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0241  amino acid permease  74.13 
 
 
543 aa  711    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1683  amino acid transporter  100 
 
 
508 aa  1008    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000204712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  58.27 
 
 
515 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  55.99 
 
 
515 aa  558  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  55.6 
 
 
520 aa  554  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  57.65 
 
 
521 aa  543  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  49.9 
 
 
512 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  52.66 
 
 
503 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  50.81 
 
 
503 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  49.61 
 
 
513 aa  468  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1740  amino acid permease-associated region  52.16 
 
 
493 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  46.06 
 
 
489 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4164  amino acid permease-associated region  51.82 
 
 
537 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.696427  normal  0.49431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  49.49 
 
 
516 aa  451  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  49.11 
 
 
499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1368  amino acid permease-associated region  51.73 
 
 
490 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4360  amino acid permease-associated region  47.99 
 
 
686 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120164  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1332  amino acid permease-associated region  51.73 
 
 
490 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1349  amino acid permease-associated region  51.73 
 
 
490 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.923637  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  46.02 
 
 
500 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  47.96 
 
 
500 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  45.73 
 
 
492 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13282  cationic amino acid transport integral membrane protein  47.78 
 
 
495 aa  415  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.260226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  44.81 
 
 
504 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  46.01 
 
 
517 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  45.29 
 
 
491 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  43.6 
 
 
495 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  42.25 
 
 
485 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  43.08 
 
 
501 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  38.67 
 
 
476 aa  356  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  40.12 
 
 
501 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  38.91 
 
 
496 aa  349  7e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  38.91 
 
 
496 aa  349  7e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  39.25 
 
 
467 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  39.45 
 
 
467 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  39.45 
 
 
467 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  39.25 
 
 
467 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  39.25 
 
 
467 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  39.45 
 
 
467 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  39.25 
 
 
467 aa  346  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  40.52 
 
 
466 aa  346  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  40.52 
 
 
466 aa  346  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  38.9 
 
 
476 aa  345  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  40.85 
 
 
465 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  40.12 
 
 
466 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  39.92 
 
 
468 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  39.92 
 
 
468 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  39.92 
 
 
468 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  39.4 
 
 
490 aa  344  2e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  38.82 
 
 
476 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  40.76 
 
 
549 aa  343  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  39.92 
 
 
468 aa  343  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  39.26 
 
 
471 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  39.06 
 
 
471 aa  342  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  39.29 
 
 
471 aa  342  8e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  39.29 
 
 
471 aa  342  8e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  40.88 
 
 
466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  38.74 
 
 
495 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  38.86 
 
 
467 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  38.66 
 
 
467 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  39.76 
 
 
471 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  37.97 
 
 
566 aa  335  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  39.03 
 
 
476 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  40.12 
 
 
465 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  39.31 
 
 
467 aa  334  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  38.52 
 
 
496 aa  334  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  40 
 
 
467 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  40 
 
 
467 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  40 
 
 
467 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  40 
 
 
467 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  40 
 
 
467 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  40 
 
 
467 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  40 
 
 
467 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  39.8 
 
 
467 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  39.57 
 
 
494 aa  330  4e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  38.83 
 
 
469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  38.43 
 
 
489 aa  327  3e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  37.03 
 
 
486 aa  326  7e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  37.75 
 
 
471 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  37.75 
 
 
471 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  37.55 
 
 
471 aa  324  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  37.55 
 
 
471 aa  324  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  37.55 
 
 
471 aa  324  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  37.55 
 
 
471 aa  324  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  40.64 
 
 
463 aa  324  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  37.55 
 
 
471 aa  324  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  37.23 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  37.23 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  36.82 
 
 
471 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  37.13 
 
 
460 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  37.85 
 
 
481 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  36.95 
 
 
463 aa  317  4e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  36.95 
 
 
463 aa  316  7e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  34.51 
 
 
471 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  38.97 
 
 
495 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  35.67 
 
 
494 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  37.58 
 
 
488 aa  312  6.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  38.17 
 
 
486 aa  313  6.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  37.65 
 
 
502 aa  312  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  36.96 
 
 
480 aa  312  9e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>