More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1276 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1276  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 480 aa  941    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  30.7 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  30.28 
 
 		 480 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1531  amino acid permease-associated region  30.84 
 
 		 479 aa  201  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  30.67 
 
 		 468 aa  199  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 		 486 aa  192  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 468 aa  176  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20300  amino acid transporter  27.93 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.533363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3189  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0232  amino acid permease family protein  28.01 
 
 		 496 aa  160  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0607  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0621  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0221  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 490 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0244  amino acid permease-associated region  30.08 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.912876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21570  amino acid transporter  28.46 
 
 		 503 aa  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.393168  hitchhiker  0.00168939 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0974  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 		 502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0152  amino acid permease family protein  26.19 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.237797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0730  amino acid permease family protein  24.84 
 
 		 436 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0717  amino acid permease family protein  24.84 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22930  amino acid transporter  25.52 
 
 		 494 aa  103  9e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0974202 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  25 
 
 		 471 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 466 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 489 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.58 
 
 		 471 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.58 
 
 		 471 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.58 
 
 		 471 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 506 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 		 630 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  23.71 
 
 		 486 aa  90.9  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  24.2 
 
 		 468 aa  90.5  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  22.29 
 
 		 494 aa  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  23.78 
 
 		 476 aa  90.1  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  23.08 
 
 		 467 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.16 
 
 		 490 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  24.16 
 
 		 466 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 		 463 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 468 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  24.12 
 
 		 471 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  24.58 
 
 		 471 aa  87.8  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  23.75 
 
 		 471 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  24.16 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  24.16 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  24.16 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 		 466 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  24.38 
 
 		 471 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 501 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  24.58 
 
 		 471 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  22.76 
 
 		 467 aa  87  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  22.02 
 
 		 480 aa  86.7  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  22.67 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  22.67 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 518 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  22.67 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  23.73 
 
 		 481 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  22.72 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  22.75 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  22.67 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  29.02 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  29.02 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  29.02 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  29.02 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  23.7 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  24.17 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  27.7 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.1 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  22.87 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  24.52 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  29.02 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  22.45 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  24.52 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  22.85 
 
 		 486 aa  83.2  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  22.67 
 
 		 495 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  24.52 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  24.52 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  23.25 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  22.24 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  22.95 
 
 		 520 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 566 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  23.29 
 
 		 491 aa  81.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  23.27 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  23.27 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  22.42 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  23.53 
 
 		 485 aa  81.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  25.37 
 
 		 541 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  24.29 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  24.05 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  24.29 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  22.55 
 
 		 496 aa  80.9  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  24.29 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  24.02 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>