More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3706 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  100 
 
 
483 aa  960    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1223  amino acid permease-associated region  73.2 
 
 
490 aa  590  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  59.58 
 
 
487 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3885  amino acid permease-associated region  59.53 
 
 
487 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  57.11 
 
 
473 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1820  amino acid permease-associated region  59.08 
 
 
486 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  45.05 
 
 
489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  47.02 
 
 
471 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  43.48 
 
 
471 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  42.61 
 
 
471 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  45.45 
 
 
471 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  44.1 
 
 
471 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  45.67 
 
 
471 aa  385  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  45.67 
 
 
471 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  45.45 
 
 
471 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  46.24 
 
 
476 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  43.04 
 
 
471 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  43.04 
 
 
471 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  43.04 
 
 
471 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  43.04 
 
 
471 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  43.04 
 
 
471 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  43.04 
 
 
471 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  43.04 
 
 
471 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  44.97 
 
 
476 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  45.16 
 
 
467 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  45.53 
 
 
491 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  41.3 
 
 
471 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  41.3 
 
 
471 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  41.3 
 
 
471 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  45.6 
 
 
492 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  45.12 
 
 
467 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  44.96 
 
 
476 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  41.74 
 
 
471 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  44.61 
 
 
467 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  44.61 
 
 
467 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  45.12 
 
 
467 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  44.61 
 
 
467 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  44.61 
 
 
467 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  44.61 
 
 
467 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  43.5 
 
 
495 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  45.2 
 
 
467 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  43.12 
 
 
500 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  44.4 
 
 
467 aa  369  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  40.66 
 
 
490 aa  365  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  42.49 
 
 
506 aa  365  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  45.22 
 
 
476 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  44.57 
 
 
471 aa  364  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  45.86 
 
 
495 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  41.3 
 
 
471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  45.95 
 
 
517 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  45.26 
 
 
466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  41.3 
 
 
471 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  40.87 
 
 
471 aa  356  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  41.44 
 
 
496 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  41.09 
 
 
471 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  41.44 
 
 
496 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  40.69 
 
 
471 aa  353  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  42.27 
 
 
463 aa  352  5.9999999999999994e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  45.45 
 
 
481 aa  352  7e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  42.27 
 
 
463 aa  352  8.999999999999999e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  44.74 
 
 
465 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  43.47 
 
 
494 aa  352  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  41.46 
 
 
502 aa  350  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  43.4 
 
 
469 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  45.18 
 
 
468 aa  347  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  45.06 
 
 
466 aa  346  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  45.09 
 
 
466 aa  346  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  42.89 
 
 
482 aa  345  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  44.87 
 
 
468 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  44.87 
 
 
468 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  42.86 
 
 
512 aa  344  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  44.97 
 
 
468 aa  345  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  41.34 
 
 
486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  43.7 
 
 
501 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  44.87 
 
 
466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  45.74 
 
 
468 aa  343  4e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  41.06 
 
 
503 aa  343  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  40.08 
 
 
549 aa  343  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  41.75 
 
 
483 aa  342  1e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  42.43 
 
 
504 aa  342  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  44.3 
 
 
465 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  43.42 
 
 
495 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  41.33 
 
 
488 aa  340  4e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  41.65 
 
 
496 aa  339  5e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  41.54 
 
 
496 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  42.25 
 
 
460 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  45.24 
 
 
463 aa  336  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  44.87 
 
 
467 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  44.87 
 
 
467 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  44.87 
 
 
467 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  44.87 
 
 
467 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  44.87 
 
 
467 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  44.87 
 
 
467 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  44.87 
 
 
467 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  44.87 
 
 
467 aa  334  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  40.08 
 
 
478 aa  333  5e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  41.46 
 
 
489 aa  332  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4360  amino acid permease-associated region  43.45 
 
 
686 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120164  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  41.2 
 
 
503 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  40.89 
 
 
495 aa  330  3e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>