More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1223 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  73.2 
 
 		 483 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1223  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 490 aa  969    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  58.63 
 
 		 487 aa  496  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  57.62 
 
 		 473 aa  493  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3885  amino acid permease-associated region  57.53 
 
 		 487 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1820  amino acid permease-associated region  57.99 
 
 		 486 aa  462  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  46.04 
 
 		 489 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  42.51 
 
 		 490 aa  392  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  43.64 
 
 		 471 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  43.64 
 
 		 471 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  45.57 
 
 		 476 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  43.64 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  43.43 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  41.72 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  41.72 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  41.72 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  41.93 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  44.04 
 
 		 467 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  42.35 
 
 		 471 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  41.72 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  42.16 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  41.93 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  45.78 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  41.72 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  44.04 
 
 		 467 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  44.26 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  44.04 
 
 		 467 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  44.04 
 
 		 467 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  44.04 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  43.83 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  44.04 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  44.26 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  43.19 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  41.09 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  45.82 
 
 		 476 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  41.55 
 
 		 502 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  41.72 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  47.45 
 
 		 492 aa  365  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  41.3 
 
 		 495 aa  365  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  45.23 
 
 		 476 aa  363  4e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  45.82 
 
 		 476 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  41.42 
 
 		 506 aa  360  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  44.35 
 
 		 465 aa  359  7e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  39.5 
 
 		 471 aa  359  8e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  39.5 
 
 		 471 aa  359  8e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  39.5 
 
 		 471 aa  359  8e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  42.54 
 
 		 494 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  43.5 
 
 		 469 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  43.64 
 
 		 500 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  42.68 
 
 		 495 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  44.47 
 
 		 491 aa  356  5.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  41.88 
 
 		 496 aa  355  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  41.88 
 
 		 496 aa  355  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  39.75 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  45.49 
 
 		 468 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  45.59 
 
 		 466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  45.13 
 
 		 468 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  45.13 
 
 		 468 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  44.16 
 
 		 501 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  45.13 
 
 		 468 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  44.44 
 
 		 465 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  45.38 
 
 		 466 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  45.75 
 
 		 495 aa  350  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  43.33 
 
 		 482 aa  350  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  42.53 
 
 		 478 aa  349  6e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  42.34 
 
 		 495 aa  348  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  45.16 
 
 		 466 aa  348  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  40.42 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  45.99 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  39.2 
 
 		 471 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  44.85 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  39.29 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  40.47 
 
 		 463 aa  344  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  44.82 
 
 		 517 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  39.2 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  41.89 
 
 		 486 aa  345  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  38.99 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  41.05 
 
 		 503 aa  343  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  40.26 
 
 		 463 aa  342  9e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  38.99 
 
 		 471 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  42.08 
 
 		 496 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  44.77 
 
 		 481 aa  341  2e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  44.38 
 
 		 497 aa  340  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  40.82 
 
 		 489 aa  339  5e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  40.55 
 
 		 512 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  42.6 
 
 		 467 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  42.54 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  43.33 
 
 		 518 aa  335  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  39.92 
 
 		 549 aa  334  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  41.21 
 
 		 480 aa  335  2e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  40.08 
 
 		 486 aa  333  4e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  38.6 
 
 		 566 aa  333  4e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  41.81 
 
 		 504 aa  332  7.000000000000001e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  44.04 
 
 		 467 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  44.04 
 
 		 467 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  44.04 
 
 		 467 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  40.52 
 
 		 501 aa  330  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  41.25 
 
 		 503 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  43.83 
 
 		 467 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  43.83 
 
 		 467 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>