More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1820 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  81.08 
 
 		 487 aa  723    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1820  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 486 aa  953    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3885  amino acid permease-associated region  79.67 
 
 		 487 aa  714    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  59.08 
 
 		 483 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1223  amino acid permease-associated region  57.99 
 
 		 490 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  55.07 
 
 		 473 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  41.88 
 
 		 471 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  41.88 
 
 		 471 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  41.88 
 
 		 471 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  41.88 
 
 		 471 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  41.67 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  41.88 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  41.88 
 
 		 471 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  41.88 
 
 		 471 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  41.38 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  41.67 
 
 		 471 aa  372  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  44.56 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  40.16 
 
 		 490 aa  368  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  40.59 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  40.59 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  40.59 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  45.47 
 
 		 500 aa  363  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  43.91 
 
 		 471 aa  362  9e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  43.91 
 
 		 471 aa  362  9e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  44.03 
 
 		 471 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  43.82 
 
 		 471 aa  359  6e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  43.61 
 
 		 471 aa  359  6e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  44.21 
 
 		 476 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  41.24 
 
 		 471 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  40.6 
 
 		 471 aa  352  8e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  39.75 
 
 		 471 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  42.14 
 
 		 506 aa  351  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  40.17 
 
 		 471 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  40.17 
 
 		 471 aa  350  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  40.17 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  43.05 
 
 		 467 aa  346  7e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  43.05 
 
 		 467 aa  346  7e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  43.27 
 
 		 467 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  43.27 
 
 		 467 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  39.22 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  43.05 
 
 		 467 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  43.71 
 
 		 467 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  43.05 
 
 		 467 aa  342  7e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  40.33 
 
 		 549 aa  342  8e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  45.68 
 
 		 468 aa  342  9e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  43.05 
 
 		 467 aa  341  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  42.03 
 
 		 495 aa  341  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  42.71 
 
 		 494 aa  340  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  41.9 
 
 		 463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  42.92 
 
 		 467 aa  340  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  41.56 
 
 		 463 aa  340  4e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 494 aa  340  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  45.62 
 
 		 495 aa  339  7e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  44.63 
 
 		 468 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  45.73 
 
 		 466 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  42.48 
 
 		 476 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  44.87 
 
 		 468 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  43.27 
 
 		 467 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  44.87 
 
 		 468 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  45.11 
 
 		 466 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  40.68 
 
 		 566 aa  334  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  38.92 
 
 		 496 aa  333  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  38.92 
 
 		 496 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  44.35 
 
 		 492 aa  333  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  45.15 
 
 		 466 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  44.3 
 
 		 466 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  41.36 
 
 		 467 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  42.8 
 
 		 495 aa  329  6e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  46.2 
 
 		 481 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  41.19 
 
 		 488 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  42.57 
 
 		 495 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  42.77 
 
 		 468 aa  325  9e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  40.12 
 
 		 518 aa  324  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  39.96 
 
 		 496 aa  325  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  42.44 
 
 		 504 aa  325  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  42.29 
 
 		 460 aa  323  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  45.05 
 
 		 463 aa  323  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  42.63 
 
 		 517 aa  323  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  44.42 
 
 		 467 aa  323  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  42.2 
 
 		 476 aa  322  7e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  41.61 
 
 		 481 aa  322  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  42.3 
 
 		 538 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  43.37 
 
 		 467 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  43.37 
 
 		 467 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  41.67 
 
 		 476 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  43.37 
 
 		 467 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  43.37 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  43.37 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  43.37 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  43.37 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  43.37 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  42.51 
 
 		 497 aa  317  4e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  43.75 
 
 		 478 aa  316  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  42.8 
 
 		 500 aa  316  6e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  41.22 
 
 		 491 aa  316  7e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  40.47 
 
 		 503 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  37.74 
 
 		 460 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  42.28 
 
 		 501 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  40.16 
 
 		 480 aa  311  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  39.45 
 
 		 512 aa  311  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>