More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1109 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  86.82 
 
 		 500 aa  800    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 538 aa  1065    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  57.29 
 
 		 486 aa  547  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  61.09 
 
 		 495 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  65.65 
 
 		 481 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  58.01 
 
 		 494 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  61.03 
 
 		 474 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  49.68 
 
 		 491 aa  415  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  50.21 
 
 		 481 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  46.97 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  43.94 
 
 		 476 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  43.5 
 
 		 476 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  43.4 
 
 		 471 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  43.4 
 
 		 471 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  42.98 
 
 		 471 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  43.22 
 
 		 471 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  40.25 
 
 		 489 aa  359  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  42.98 
 
 		 471 aa  359  8e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  42.38 
 
 		 476 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  42.7 
 
 		 476 aa  355  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  41.08 
 
 		 549 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  44.88 
 
 		 488 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  40.09 
 
 		 471 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  40.09 
 
 		 471 aa  353  4e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  40.09 
 
 		 471 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  40.09 
 
 		 471 aa  353  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  40.09 
 
 		 471 aa  353  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  40.09 
 
 		 471 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  43.31 
 
 		 466 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  40.09 
 
 		 471 aa  352  7e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  43.1 
 
 		 466 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  42.37 
 
 		 468 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  42.89 
 
 		 468 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  42.89 
 
 		 468 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  42.89 
 
 		 468 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  42.68 
 
 		 466 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  39.66 
 
 		 471 aa  350  5e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  39.76 
 
 		 495 aa  349  9e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  40.12 
 
 		 494 aa  347  3e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  38.81 
 
 		 471 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  40.98 
 
 		 518 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  40.74 
 
 		 506 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  39.39 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  42.13 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  45.45 
 
 		 481 aa  342  1e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  42.11 
 
 		 482 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  41.77 
 
 		 465 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  41.77 
 
 		 465 aa  337  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  38.54 
 
 		 490 aa  336  5.999999999999999e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  41.59 
 
 		 467 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  41.59 
 
 		 467 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  42.8 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  42.8 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  42.8 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  39.7 
 
 		 463 aa  333  4e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  42.49 
 
 		 463 aa  333  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  39.18 
 
 		 566 aa  333  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  42.8 
 
 		 467 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  42.8 
 
 		 467 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  41.26 
 
 		 467 aa  333  6e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  42.8 
 
 		 467 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  42.8 
 
 		 467 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  39.91 
 
 		 463 aa  333  7.000000000000001e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  40.91 
 
 		 469 aa  332  8e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  41.59 
 
 		 467 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  40.8 
 
 		 467 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  41.38 
 
 		 467 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  42.37 
 
 		 467 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  39.92 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  41.81 
 
 		 467 aa  331  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  39.92 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  41.38 
 
 		 467 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  41.89 
 
 		 468 aa  331  3e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  41.38 
 
 		 467 aa  330  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  41.81 
 
 		 467 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  38.92 
 
 		 501 aa  329  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  38.59 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  39.92 
 
 		 495 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  39.76 
 
 		 500 aa  326  5e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  42.24 
 
 		 501 aa  324  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  39.68 
 
 		 495 aa  324  3e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  36.61 
 
 		 471 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  36.61 
 
 		 471 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  36.61 
 
 		 471 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  40.77 
 
 		 492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  39.05 
 
 		 496 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  41.72 
 
 		 463 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  40.33 
 
 		 496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  39.17 
 
 		 483 aa  319  7e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  41.58 
 
 		 495 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  39.26 
 
 		 489 aa  318  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  41.94 
 
 		 473 aa  317  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  38.43 
 
 		 486 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  38.43 
 
 		 486 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  36.95 
 
 		 478 aa  315  9e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  35.93 
 
 		 471 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  37.88 
 
 		 497 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3885  amino acid permease-associated region  42.07 
 
 		 487 aa  313  5.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  37.72 
 
 		 504 aa  312  9e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  38.28 
 
 		 503 aa  312  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>