More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3620 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 494 aa  965    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  54.81 
 
 		 486 aa  510  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  57.88 
 
 		 495 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  59.58 
 
 		 481 aa  497  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  57.97 
 
 		 538 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  57.3 
 
 		 500 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  56.77 
 
 		 474 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  48.21 
 
 		 481 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  47.66 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  47.02 
 
 		 491 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  44.64 
 
 		 476 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  45.96 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  44.19 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  40.95 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  40.95 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  40.95 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  41.16 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  41.59 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  40.95 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  40.95 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  40.95 
 
 		 471 aa  369  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  40.51 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  44.66 
 
 		 476 aa  364  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  44.8 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  46.22 
 
 		 466 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  40.3 
 
 		 471 aa  362  6e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  42.8 
 
 		 471 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  42.8 
 
 		 471 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  46.22 
 
 		 467 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  46.22 
 
 		 467 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  46.22 
 
 		 467 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  43.36 
 
 		 467 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  43.36 
 
 		 467 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  46.22 
 
 		 467 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  46.22 
 
 		 467 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  46.22 
 
 		 467 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  46.22 
 
 		 467 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  46.22 
 
 		 467 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  43.58 
 
 		 467 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  43.36 
 
 		 467 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  42.28 
 
 		 471 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  42.86 
 
 		 467 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  42.28 
 
 		 471 aa  355  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  39.14 
 
 		 549 aa  355  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  43.58 
 
 		 467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  42.86 
 
 		 467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  44.71 
 
 		 466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  44.3 
 
 		 466 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  44.49 
 
 		 468 aa  352  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  44.3 
 
 		 468 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  44.3 
 
 		 468 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  44.3 
 
 		 468 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  44.92 
 
 		 466 aa  351  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  44.89 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  40.52 
 
 		 471 aa  350  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  44.26 
 
 		 465 aa  350  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  39.88 
 
 		 489 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  42.86 
 
 		 467 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  42.64 
 
 		 467 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  38.71 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  38.71 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  38.71 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  42.92 
 
 		 468 aa  347  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  44.15 
 
 		 467 aa  346  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  39.75 
 
 		 496 aa  346  5e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  39.75 
 
 		 496 aa  346  5e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  43.59 
 
 		 465 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  44.64 
 
 		 463 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  40.72 
 
 		 463 aa  342  8e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  39.6 
 
 		 500 aa  342  8e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  41.52 
 
 		 518 aa  342  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  40.51 
 
 		 463 aa  341  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  38.4 
 
 		 490 aa  341  2e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  38.72 
 
 		 496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  42.27 
 
 		 486 aa  339  5.9999999999999996e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  39.43 
 
 		 501 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  38.71 
 
 		 471 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  38.92 
 
 		 471 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  36.99 
 
 		 471 aa  335  9e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  39.26 
 
 		 525 aa  335  9e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  40.17 
 
 		 506 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  37.75 
 
 		 566 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  45.42 
 
 		 543 aa  334  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  41.81 
 
 		 488 aa  333  4e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  38.49 
 
 		 471 aa  333  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  38.06 
 
 		 471 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2567  amino acid permease-associated region  42.31 
 
 		 507 aa  332  8e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  38.49 
 
 		 471 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  45.81 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  38.59 
 
 		 480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  43.21 
 
 		 495 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  38.53 
 
 		 481 aa  326  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  40.99 
 
 		 496 aa  326  6e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  38.72 
 
 		 495 aa  326  6e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  42.77 
 
 		 480 aa  325  9e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  40.04 
 
 		 501 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  42 
 
 		 476 aa  323  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  42 
 
 		 476 aa  323  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  39.88 
 
 		 494 aa  324  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  40.33 
 
 		 483 aa  323  5e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>