More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0820 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  97.71 
 
 
480 aa  924    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1531  amino acid permease-associated region  79.83 
 
 
479 aa  771    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  100 
 
 
480 aa  944    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  54.85 
 
 
486 aa  496  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  52.03 
 
 
468 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  50.54 
 
 
468 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20300  amino acid transporter  46.52 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.533363  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0244  amino acid permease-associated region  46.39 
 
 
475 aa  342  9e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.912876  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0607  amino acid permease-associated region  33.12 
 
 
494 aa  216  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0621  amino acid permease-associated region  33.12 
 
 
494 aa  216  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0232  amino acid permease family protein  30.8 
 
 
496 aa  212  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0974  amino acid permease-associated region  31.76 
 
 
502 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0221  amino acid permease-associated region  28.25 
 
 
490 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21570  amino acid transporter  33.27 
 
 
503 aa  196  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.393168  hitchhiker  0.00168939 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1276  amino acid permease-associated region  30.13 
 
 
480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0717  amino acid permease family protein  29.14 
 
 
443 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0730  amino acid permease family protein  28.98 
 
 
436 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.76 
 
 
489 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0152  amino acid permease family protein  27.35 
 
 
451 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.237797  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3189  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 
482 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 
506 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.94 
 
 
486 aa  136  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22930  amino acid transporter  27.27 
 
 
494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0974202 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.67 
 
 
471 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  27.27 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 
473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 
468 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 
468 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 
468 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 
466 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.47 
 
 
476 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 
518 aa  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 
466 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  28.6 
 
 
468 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 
496 aa  124  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 
566 aa  123  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  28.42 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  28.42 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 
466 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  27.51 
 
 
492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  25.81 
 
 
486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  25.81 
 
 
486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 
495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  26.99 
 
 
467 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  26.99 
 
 
467 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  26.99 
 
 
467 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25.16 
 
 
483 aa  121  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  28.66 
 
 
467 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  28.66 
 
 
467 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  26.99 
 
 
467 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  27.09 
 
 
491 aa  121  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  26.99 
 
 
467 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 
469 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  28.66 
 
 
467 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  25.41 
 
 
503 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27.48 
 
 
467 aa  120  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  26.69 
 
 
471 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  26.69 
 
 
471 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  26.69 
 
 
471 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  28.12 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  28.02 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  28.39 
 
 
466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 
538 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.92 
 
 
471 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.74 
 
 
471 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.74 
 
 
471 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.74 
 
 
471 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  27.02 
 
 
467 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.74 
 
 
471 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.95 
 
 
471 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.74 
 
 
471 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  27.12 
 
 
467 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 
471 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  27.12 
 
 
467 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.53 
 
 
471 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  27.12 
 
 
467 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  26.35 
 
 
525 aa  117  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  25.94 
 
 
462 aa  117  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  27.12 
 
 
467 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1866  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 
458 aa  116  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 
488 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  26.24 
 
 
460 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.37 
 
 
476 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.69 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 
495 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  26.27 
 
 
471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  27.03 
 
 
467 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  24.36 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 
501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 
467 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 
481 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 
495 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 
517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  28.5 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 
471 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  25.58 
 
 
465 aa  114  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  27.12 
 
 
467 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  24.46 
 
 
474 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>