More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2221 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 495 aa  969    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  69.21 
 
 		 474 aa  594  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  62.27 
 
 		 486 aa  589  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  69.83 
 
 		 481 aa  560  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  58.46 
 
 		 494 aa  534  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  61.26 
 
 		 538 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  60.82 
 
 		 500 aa  526  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  49.48 
 
 		 491 aa  435  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  52.45 
 
 		 481 aa  428  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  48.72 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  47.21 
 
 		 476 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  47.7 
 
 		 476 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  47.76 
 
 		 476 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  48.29 
 
 		 467 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  47.86 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  47.86 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  47.86 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  47.86 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  46.58 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  47.86 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  47.86 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  47.35 
 
 		 466 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  47.86 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  46.28 
 
 		 466 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  46.5 
 
 		 466 aa  389  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  45.94 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  45.94 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  45.94 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  44.75 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  44.89 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  44.54 
 
 		 471 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  45.74 
 
 		 466 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  45.01 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  41.39 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  41.39 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  41.39 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  41.39 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  41.18 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  41.56 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  41.39 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  41.39 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  44.42 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  41.18 
 
 		 471 aa  369  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  43.19 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  41.56 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  43.19 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  43.19 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  42.98 
 
 		 471 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  45.18 
 
 		 463 aa  362  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  44.61 
 
 		 518 aa  361  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  41.27 
 
 		 549 aa  359  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  41.6 
 
 		 471 aa  359  6e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  41.63 
 
 		 467 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  41.63 
 
 		 467 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  41.5 
 
 		 489 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  41.63 
 
 		 467 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  41.63 
 
 		 467 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  41.42 
 
 		 467 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  41.42 
 
 		 467 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  41.84 
 
 		 467 aa  353  4e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  44.66 
 
 		 463 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  41.63 
 
 		 467 aa  350  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  45.89 
 
 		 481 aa  348  1e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  41.21 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  40.98 
 
 		 463 aa  347  4e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  38.28 
 
 		 471 aa  345  7e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  39.29 
 
 		 525 aa  345  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  38.7 
 
 		 471 aa  345  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  38.7 
 
 		 471 aa  345  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  38.7 
 
 		 471 aa  345  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  40.8 
 
 		 506 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  40.76 
 
 		 463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  41 
 
 		 467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2567  amino acid permease-associated region  43 
 
 		 507 aa  343  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275493 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  37.3 
 
 		 496 aa  342  7e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  37.3 
 
 		 496 aa  342  7e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  37.32 
 
 		 501 aa  342  9e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  40.53 
 
 		 496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  38.91 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  38.91 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  39.12 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  40.66 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  39.84 
 
 		 495 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  38.91 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  42.52 
 
 		 488 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  38.62 
 
 		 566 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  38.7 
 
 		 471 aa  336  7e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  37.5 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  41.09 
 
 		 468 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  37.8 
 
 		 490 aa  332  1e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  43.31 
 
 		 495 aa  331  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  39.84 
 
 		 486 aa  330  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  38.65 
 
 		 486 aa  330  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  39.84 
 
 		 486 aa  330  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  38.8 
 
 		 494 aa  329  7e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  40.79 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  40.55 
 
 		 486 aa  325  1e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  37.86 
 
 		 489 aa  323  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  42.54 
 
 		 492 aa  323  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  36.76 
 
 		 480 aa  323  4e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>