More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22930 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_22930  amino acid transporter  100 
 
 		 494 aa  958    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0974202 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  31.71 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 468 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 486 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 		 480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0244  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 475 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.912876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  26.92 
 
 		 480 aa  140  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20300  amino acid transporter  27.29 
 
 		 471 aa  136  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.533363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1531  amino acid permease-associated region  28.75 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0221  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 490 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0607  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 494 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0621  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 494 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0232  amino acid permease family protein  23.45 
 
 		 496 aa  115  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0974  amino acid permease-associated region  25.22 
 
 		 502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3189  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21570  amino acid transporter  29.78 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.393168  hitchhiker  0.00168939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 496 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 439 aa  96.7  9e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  24.95 
 
 		 496 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  24.95 
 
 		 496 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 494 aa  95.1  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  23.43 
 
 		 483 aa  94.4  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 518 aa  93.6  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  24.65 
 
 		 476 aa  93.2  9e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 		 492 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 786 aa  92.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1276  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 480 aa  91.7  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  23.22 
 
 		 467 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  23.06 
 
 		 467 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 520 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  25.91 
 
 		 465 aa  87.8  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 506 aa  86.7  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  23.01 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  22.85 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 482 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 521 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  22.85 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0730  amino acid permease family protein  22.08 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0717  amino acid permease family protein  22.08 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 538 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  22.8 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  22.85 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  22.58 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  22.85 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  22.58 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  22.58 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  22.85 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1866  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  24.77 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  24.05 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 496 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  22.81 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  23.49 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 503 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.46 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  21.81 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 745 aa  80.9  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  24.95 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  23.44 
 
 		 486 aa  80.1  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  25.41 
 
 		 528 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  24.54 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  24.77 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  25.24 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  22.38 
 
 		 467 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 770 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  24.77 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  24.86 
 
 		 528 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  22.57 
 
 		 471 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  22.31 
 
 		 515 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  22.09 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  24.53 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  22.57 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  24.24 
 
 		 512 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  21.89 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  26.85 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  22.09 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4907  amino acid permease-associated region  24.08 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  27.39 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3459  amino acid permease-associated region  24.08 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  24.88 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  25.23 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  21.7 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>