More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2158 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  100 
 
 		 483 aa  956    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  89.63 
 
 		 482 aa  874    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  70.04 
 
 		 490 aa  652    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  89.63 
 
 		 482 aa  874    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  69.23 
 
 		 483 aa  660    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  64.58 
 
 		 465 aa  605  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  61.67 
 
 		 476 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  57.14 
 
 		 476 aa  576  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  43.67 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  43.01 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  40.81 
 
 		 462 aa  357  2.9999999999999997e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  42.92 
 
 		 463 aa  356  5.999999999999999e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  37.74 
 
 		 467 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  37.74 
 
 		 467 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  37.74 
 
 		 467 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  36.82 
 
 		 467 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  37.53 
 
 		 467 aa  295  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  38.36 
 
 		 467 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  36.61 
 
 		 467 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  37.31 
 
 		 467 aa  292  9e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  37.24 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  36.09 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  37.24 
 
 		 467 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  35.32 
 
 		 490 aa  290  4e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  37.45 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  37.07 
 
 		 471 aa  286  8e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  37.07 
 
 		 471 aa  286  8e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  36.88 
 
 		 471 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  34.88 
 
 		 471 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  36.88 
 
 		 471 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  33.4 
 
 		 471 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  33.4 
 
 		 471 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  33.4 
 
 		 471 aa  279  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  33.4 
 
 		 471 aa  279  9e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  39.95 
 
 		 427 aa  277  3e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  32.92 
 
 		 471 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  33.89 
 
 		 483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  32.3 
 
 		 471 aa  272  9e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  33.12 
 
 		 471 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  33.95 
 
 		 496 aa  272  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  32.92 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  32.92 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  32.92 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  32.92 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  32.92 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  36.89 
 
 		 495 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  35.22 
 
 		 486 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  32.92 
 
 		 471 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  33.4 
 
 		 471 aa  270  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  33.19 
 
 		 471 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  33.4 
 
 		 471 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  33.61 
 
 		 471 aa  269  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 		 500 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  33.62 
 
 		 471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  35.36 
 
 		 481 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  36.56 
 
 		 476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  34.14 
 
 		 515 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  33.62 
 
 		 471 aa  266  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  33.82 
 
 		 488 aa  266  8e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  34.31 
 
 		 495 aa  266  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  35.2 
 
 		 492 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  34.94 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  33.69 
 
 		 496 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  34.05 
 
 		 476 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  33.69 
 
 		 496 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 		 482 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  33.87 
 
 		 566 aa  263  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  34.59 
 
 		 506 aa  262  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  36.23 
 
 		 468 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  36.13 
 
 		 481 aa  260  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  34.24 
 
 		 506 aa  260  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  34.43 
 
 		 466 aa  259  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  34.9 
 
 		 473 aa  259  7e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  33.27 
 
 		 520 aa  259  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  34.52 
 
 		 480 aa  258  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  36.02 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  36.02 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  34.86 
 
 		 480 aa  257  3e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  36.02 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  36.02 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  34.61 
 
 		 478 aa  257  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  33.61 
 
 		 496 aa  257  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  35.89 
 
 		 494 aa  257  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  32.72 
 
 		 480 aa  257  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  35.89 
 
 		 471 aa  256  8e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  34.02 
 
 		 549 aa  256  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  33.33 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  35.81 
 
 		 466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  36.52 
 
 		 543 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  33.93 
 
 		 516 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  35.81 
 
 		 466 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  36.02 
 
 		 461 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  36.02 
 
 		 467 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  36.02 
 
 		 467 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  36.02 
 
 		 467 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  35.5 
 
 		 489 aa  253  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  35.63 
 
 		 495 aa  253  8.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  36.02 
 
 		 467 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  36.02 
 
 		 467 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>