More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0388 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  69.23 
 
 
483 aa  651    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  71.16 
 
 
490 aa  638    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  70.97 
 
 
482 aa  675    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  70.97 
 
 
482 aa  675    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  100 
 
 
483 aa  958    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  65.07 
 
 
465 aa  592  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  64.58 
 
 
476 aa  584  1.0000000000000001e-165  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  58.26 
 
 
476 aa  572  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  43.79 
 
 
466 aa  376  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  45.63 
 
 
465 aa  372  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  40.55 
 
 
462 aa  346  6e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  42.98 
 
 
463 aa  339  7e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  38.51 
 
 
471 aa  301  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  38.51 
 
 
471 aa  301  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  38.02 
 
 
471 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  38.01 
 
 
460 aa  297  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  38.22 
 
 
471 aa  296  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  36.25 
 
 
467 aa  296  7e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  36.25 
 
 
467 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  36.25 
 
 
467 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  36.25 
 
 
467 aa  293  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  36.25 
 
 
467 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  36.25 
 
 
467 aa  292  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  36.67 
 
 
467 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  36.04 
 
 
467 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  36.67 
 
 
467 aa  289  7e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  36.46 
 
 
467 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  35.58 
 
 
471 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  34.09 
 
 
471 aa  279  9e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  40.33 
 
 
427 aa  278  2e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  34.3 
 
 
471 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  34.76 
 
 
471 aa  276  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  34.81 
 
 
490 aa  274  2.0000000000000002e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  36.34 
 
 
486 aa  273  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  34.03 
 
 
471 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  34.03 
 
 
471 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  34.03 
 
 
471 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  37.11 
 
 
471 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  34.36 
 
 
471 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  34.36 
 
 
471 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  34.36 
 
 
471 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  34.36 
 
 
471 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  34.36 
 
 
471 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  34.36 
 
 
471 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  34.36 
 
 
471 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  37.32 
 
 
476 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  34.54 
 
 
500 aa  269  8.999999999999999e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  34.97 
 
 
471 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  35.88 
 
 
476 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  35.93 
 
 
496 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  35.64 
 
 
483 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  34.66 
 
 
471 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  34.66 
 
 
471 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  34.84 
 
 
489 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  34.66 
 
 
471 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  34.45 
 
 
471 aa  263  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  34.66 
 
 
471 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  37.45 
 
 
478 aa  261  2e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  34.84 
 
 
486 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  34.24 
 
 
496 aa  259  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  34.24 
 
 
496 aa  259  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  34.84 
 
 
486 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  36.19 
 
 
468 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  37.92 
 
 
491 aa  256  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  36.65 
 
 
495 aa  256  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  36.52 
 
 
467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  36.52 
 
 
467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  35.77 
 
 
468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  36.52 
 
 
467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  35.77 
 
 
468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  35.77 
 
 
468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  35.98 
 
 
466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  36.52 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  36.52 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  36.52 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  36.52 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  36.51 
 
 
466 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  35.25 
 
 
506 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  35.78 
 
 
464 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  35.95 
 
 
476 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  35.77 
 
 
466 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  32.71 
 
 
466 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  35.77 
 
 
466 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  36.12 
 
 
543 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  34.67 
 
 
495 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  34.13 
 
 
463 aa  251  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  36.09 
 
 
467 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  33.53 
 
 
566 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  35.55 
 
 
499 aa  250  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  34.13 
 
 
463 aa  250  5e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  33.86 
 
 
504 aa  249  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  34.39 
 
 
496 aa  249  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  35.21 
 
 
492 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  33.68 
 
 
488 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  33.73 
 
 
516 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  35.77 
 
 
489 aa  248  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  35.02 
 
 
476 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  34.18 
 
 
506 aa  247  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  32.57 
 
 
467 aa  247  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  35.34 
 
 
478 aa  246  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>