More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1150 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 476 aa  941    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  56.67 
 
 		 482 aa  565  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  56.67 
 
 		 482 aa  565  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  59.7 
 
 		 476 aa  567  1e-160  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  58.26 
 
 		 483 aa  558  1e-158  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  56.72 
 
 		 483 aa  543  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  54.76 
 
 		 490 aa  503  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  53.16 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  43.38 
 
 		 462 aa  375  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  44.13 
 
 		 463 aa  364  2e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  43.74 
 
 		 465 aa  362  6e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  41.45 
 
 		 466 aa  359  7e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  40.48 
 
 		 476 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  37.82 
 
 		 467 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  37.82 
 
 		 467 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  37.82 
 
 		 467 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  37.82 
 
 		 467 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  37.82 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  38.11 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  37.47 
 
 		 467 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  39.03 
 
 		 460 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  37.89 
 
 		 471 aa  299  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  37.61 
 
 		 467 aa  299  7e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  39.78 
 
 		 471 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  37.89 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  37.89 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  37.58 
 
 		 467 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  37.47 
 
 		 467 aa  295  9e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  37.87 
 
 		 467 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  38.07 
 
 		 496 aa  286  5.999999999999999e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  35.54 
 
 		 489 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  38.36 
 
 		 483 aa  283  5.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  34.22 
 
 		 490 aa  280  3e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  36.38 
 
 		 500 aa  280  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  35.93 
 
 		 495 aa  280  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  33.82 
 
 		 471 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1866  amino acid permease-associated region  35.85 
 
 		 458 aa  276  4e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  39.71 
 
 		 427 aa  276  5e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  33.19 
 
 		 471 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  37.26 
 
 		 486 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  36.4 
 
 		 456 aa  273  6e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  33.75 
 
 		 471 aa  273  7e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  33.75 
 
 		 471 aa  273  7e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  33.75 
 
 		 471 aa  273  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  33.75 
 
 		 471 aa  273  7e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  33.75 
 
 		 471 aa  273  7e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  33.75 
 
 		 471 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  33.75 
 
 		 471 aa  272  9e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  34.44 
 
 		 471 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  34.44 
 
 		 471 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  34.44 
 
 		 471 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  35.48 
 
 		 520 aa  269  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  37.09 
 
 		 518 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  33.61 
 
 		 471 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 		 499 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  35.56 
 
 		 506 aa  266  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  36.79 
 
 		 478 aa  266  8e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  37.69 
 
 		 506 aa  265  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  38.28 
 
 		 495 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  33.4 
 
 		 471 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  33.92 
 
 		 476 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  31.99 
 
 		 516 aa  262  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  35.34 
 
 		 494 aa  262  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  33.47 
 
 		 515 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  36.46 
 
 		 495 aa  261  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  34.82 
 
 		 496 aa  260  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  34.82 
 
 		 496 aa  260  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  37.07 
 
 		 458 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  33.92 
 
 		 476 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  34.23 
 
 		 471 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  34.4 
 
 		 486 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  33.97 
 
 		 468 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  34.4 
 
 		 486 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  33.4 
 
 		 471 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  34.23 
 
 		 471 aa  257  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  34.24 
 
 		 468 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  34.24 
 
 		 468 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  34.75 
 
 		 478 aa  256  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  34.02 
 
 		 471 aa  256  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  33.61 
 
 		 486 aa  256  8e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  34.24 
 
 		 468 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  34.44 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  34.14 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  38.05 
 
 		 481 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  32.03 
 
 		 566 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  32.52 
 
 		 549 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  35.37 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  34.46 
 
 		 466 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  34.46 
 
 		 466 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  32.59 
 
 		 512 aa  253  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  33.83 
 
 		 466 aa  253  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  34.26 
 
 		 467 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  34.26 
 
 		 467 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  34.26 
 
 		 467 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  34.26 
 
 		 467 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  34.26 
 
 		 467 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  34.26 
 
 		 467 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  35.63 
 
 		 503 aa  252  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  34.26 
 
 		 467 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>