More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1274 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  100 
 
 
458 aa  895    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  60.22 
 
 
456 aa  530  1e-149  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  47.96 
 
 
476 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  47.52 
 
 
471 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  40.77 
 
 
476 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  40.57 
 
 
489 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  43.84 
 
 
466 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  44.71 
 
 
468 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  44.71 
 
 
468 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  44.71 
 
 
468 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  44.28 
 
 
468 aa  362  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  43.41 
 
 
466 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  41.9 
 
 
476 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  44.06 
 
 
466 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  46 
 
 
471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  44.06 
 
 
466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  46 
 
 
471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  40.95 
 
 
476 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  45.78 
 
 
471 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  45.78 
 
 
471 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  44.06 
 
 
467 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  44.28 
 
 
467 aa  355  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  44.06 
 
 
467 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  44.06 
 
 
467 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  42.67 
 
 
463 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  43.84 
 
 
467 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  43.84 
 
 
467 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  43.84 
 
 
467 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  43.84 
 
 
467 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  43.98 
 
 
467 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  43.98 
 
 
467 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  41.36 
 
 
490 aa  347  2e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  42.52 
 
 
465 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  43.53 
 
 
463 aa  346  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  43.76 
 
 
467 aa  345  8e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  39.61 
 
 
496 aa  344  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  43.76 
 
 
467 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  39.61 
 
 
496 aa  344  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  43.54 
 
 
467 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  43.79 
 
 
467 aa  343  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  44.42 
 
 
460 aa  343  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  43.54 
 
 
467 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  42.53 
 
 
549 aa  342  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  43.33 
 
 
467 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  41.68 
 
 
465 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  41.03 
 
 
469 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  41.33 
 
 
486 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  41.33 
 
 
486 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  43.54 
 
 
467 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  43.54 
 
 
467 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  39.96 
 
 
500 aa  335  9e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  40.12 
 
 
501 aa  333  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  41.96 
 
 
471 aa  333  6e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  41.96 
 
 
471 aa  333  6e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  41.96 
 
 
471 aa  333  6e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  42.83 
 
 
495 aa  332  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  41.63 
 
 
496 aa  332  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  41.52 
 
 
471 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  41.52 
 
 
471 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  41.52 
 
 
471 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  41.52 
 
 
471 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  41.52 
 
 
471 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  40.65 
 
 
471 aa  329  6e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  41.52 
 
 
471 aa  329  7e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  41.52 
 
 
471 aa  328  9e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  41.05 
 
 
483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  41.96 
 
 
506 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  41.14 
 
 
496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  39.4 
 
 
496 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  40.08 
 
 
566 aa  326  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  42.4 
 
 
517 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  43.38 
 
 
491 aa  324  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  43.15 
 
 
495 aa  322  6e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  40.39 
 
 
467 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  43.61 
 
 
481 aa  322  9.000000000000001e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  40.65 
 
 
471 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  40.87 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  40.79 
 
 
495 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  40.87 
 
 
471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  42.33 
 
 
494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  40.59 
 
 
486 aa  320  3e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  41.77 
 
 
471 aa  320  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  39.71 
 
 
492 aa  320  5e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  42.19 
 
 
488 aa  319  6e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  41.99 
 
 
471 aa  319  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  42.3 
 
 
471 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  41.77 
 
 
471 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  41.34 
 
 
471 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  44.14 
 
 
495 aa  318  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  40.97 
 
 
503 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  41.56 
 
 
494 aa  315  8e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  40.09 
 
 
468 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  39.96 
 
 
501 aa  315  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  39.18 
 
 
480 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  39.22 
 
 
463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  39.22 
 
 
463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  40.43 
 
 
482 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  40.04 
 
 
478 aa  312  6.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  42.3 
 
 
473 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  38.77 
 
 
486 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>