More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1840 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  100 
 
 		 466 aa  908    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  59.78 
 
 		 465 aa  541  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  61.85 
 
 		 427 aa  488  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  48.6 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  48.59 
 
 		 463 aa  421  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  43.94 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  43.79 
 
 		 483 aa  362  5.0000000000000005e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  41.45 
 
 		 476 aa  359  7e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  41.94 
 
 		 471 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  41.08 
 
 		 471 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  40.86 
 
 		 471 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  41.74 
 
 		 482 aa  355  8.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  41.74 
 
 		 482 aa  355  8.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  41.29 
 
 		 471 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  41.29 
 
 		 471 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  41.29 
 
 		 471 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  41.29 
 
 		 471 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  41.29 
 
 		 471 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  41.51 
 
 		 471 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  41.08 
 
 		 471 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  42.24 
 
 		 476 aa  350  2e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  40.97 
 
 		 467 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  40.97 
 
 		 467 aa  349  6e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  40.97 
 
 		 467 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  40.97 
 
 		 467 aa  348  9e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  40.75 
 
 		 467 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  40.97 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  40.58 
 
 		 467 aa  346  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  40.26 
 
 		 471 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  40.26 
 
 		 471 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  40.04 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  40.04 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  41.41 
 
 		 467 aa  342  7e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  43.01 
 
 		 483 aa  340  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  38.92 
 
 		 471 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  38.92 
 
 		 471 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  38.92 
 
 		 471 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  40.97 
 
 		 467 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  40.86 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  39.19 
 
 		 476 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  40.75 
 
 		 467 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  38.92 
 
 		 471 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  41.56 
 
 		 490 aa  335  1e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  38.92 
 
 		 471 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  38.71 
 
 		 471 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  38.71 
 
 		 471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  39.3 
 
 		 467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  38.49 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  40.98 
 
 		 471 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  37.53 
 
 		 489 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  38.28 
 
 		 471 aa  323  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  39.19 
 
 		 476 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  37.86 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  38.84 
 
 		 476 aa  319  7e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  40.34 
 
 		 476 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  39.74 
 
 		 478 aa  318  2e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  39.35 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  37.72 
 
 		 496 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  36.83 
 
 		 486 aa  312  9e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  36.83 
 
 		 486 aa  312  9e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  36.2 
 
 		 500 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  35.52 
 
 		 490 aa  309  6.999999999999999e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  38.7 
 
 		 460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  37.17 
 
 		 520 aa  305  9.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  37.4 
 
 		 515 aa  305  9.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  38.49 
 
 		 465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  39.16 
 
 		 495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  37.26 
 
 		 486 aa  303  5.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  39.06 
 
 		 466 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  38.2 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  38.76 
 
 		 466 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  38.54 
 
 		 468 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  37.63 
 
 		 468 aa  300  5e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  38.59 
 
 		 466 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  37.98 
 
 		 468 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  37.98 
 
 		 468 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  38.33 
 
 		 466 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  37.98 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  37.61 
 
 		 488 aa  297  3e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  35.67 
 
 		 506 aa  296  6e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  36.48 
 
 		 492 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  36.42 
 
 		 516 aa  293  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  38.33 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  35.59 
 
 		 486 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  37.64 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  34.5 
 
 		 495 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  35.86 
 
 		 464 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  35.64 
 
 		 494 aa  290  4e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  34.71 
 
 		 549 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  37.61 
 
 		 491 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  38.41 
 
 		 467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  38.41 
 
 		 467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  38.97 
 
 		 467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  38.41 
 
 		 467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  37.28 
 
 		 518 aa  286  8e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  38.41 
 
 		 467 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  38.41 
 
 		 467 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  38.41 
 
 		 467 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  38.41 
 
 		 467 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  35.86 
 
 		 504 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>